RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C ANT1Q06497 328 aa3.28□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YOR292CQ08743 309 aa3.28□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YPL264CQ08980 353 aa3.28□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
PFA4YOL003C STF1P01098 86 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SCO1P23833 295 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C EHD3P28817 500 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C CAM1P29547 415 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C POP8P38208 133 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C COS8P38723 381 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YGL159WP53110 370 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C NRK1P53915 240 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YDR248CQ03786 193 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YDR249CQ03787 373 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C PET20Q99373 253 aa3.27□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C REP2P03872 296 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SSA3P09435 649 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C ARO4P32449 370 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SRB6P32570 121 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C EMP24P32803 203 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C CUP9P41817 306 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C GLR1P41921 483 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YJL016WP47072 561 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SNN1P48232 102 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C UBC13P52490 153 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RRT7Q07829 113 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.26□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPS23BP0CX30 145 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YHR214C-DP0CX93 97 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C IFM1P25038 676 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C FIG1P38224 298 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YPC1P38298 316 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C COX16P47081 118 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C MCM22P47167 239 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C NIF3P53081 288 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C PNC1P53184 216 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C ALG9P53868 555 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YPL039WQ03080 316 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C MIX14Q04341 121 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C GTO3Q04806 366 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RRG8Q06109 277 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SYM1Q06563 197 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C BER1Q06688 274 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa3.25□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C COX5BP00425 151 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C MDH2P22133 377 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C CNB1P25296 175 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RFA3P26755 122 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C AIM29P36154 155 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SDC1Q03323 175 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SCP1Q08873 200 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C AKR2Q12013 749 aa3.24□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C TRR1P29509 319 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C ECM14P38836 430 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C EMC5P40540 141 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C AGX1P43567 385 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YFR045WP43617 309 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C UFD1P53044 361 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C FMP41P53889 259 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C EST3Q03096 181 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C MED4Q12343 284 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C VMA9Q3E7B6 73 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C PCC1Q3E833 88 aa3.23□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C QCR2P07257 368 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YFR010W-AP0C5N0 62 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C RPL30P14120 105 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C DAL82P21705 255 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YEA6P39953 335 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C VPS28Q02767 242 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C THI74Q04083 370 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C HUT1Q12520 339 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C YAL063C-AQ3E791 96 aa3.22□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PFA4YOL003C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RFC2P40348 353 aa3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ECO1P43605 281 aa3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YCL001W-AP87012 153 aa3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SNO1Q03144 224 aa3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YPR063CQ12160 140 aa3.21□□□□□ -1.9
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