RNA–Protein interactions for RNA: YNL108C

YNL108C, Transcript of Protein phosphatase, yeast

Gene YNL108C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL108C	YNL108C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	YGL010W	P25338	174 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	AGA1	P32323	725 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	GPX1	P36014	167 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	YMC2	P38087	329 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	SFT2	P38166	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	TPC1	P53257	314 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	FIT1	Q04433	528 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	SCW10	Q04951	389 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	MSA1	Q08471	629 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	JID1	Q12350	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL108C	YNL108C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SDH4	P37298	181 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	CSH1	P38287	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	TEM1	P38987	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	GGC1	P38988	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	IRC22	P40006	225 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	AVT7	P40501	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	CLD1	P53264	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	LPP1	Q04396	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	LYS2	P07702	1392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	HAP3	P13434	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	BET1	P22804	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MTC6	P38849	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	TIM17	P39515	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YER188W	P40103	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	FSH2	Q05015	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	ATR1	P13090	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	IMP1	P28627	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	ERG2	P32352	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SMP1	P38128	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	PHO89	P38361	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	HPA3	P39979	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MPM1	P40364	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YGL193C	P53097	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YET1	P35723	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YAR029W	P39549	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SYS1	P41544	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	COA6	Q3E846	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MED11	Q99278	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	COX10	P21592	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YCR099C	P25657	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	VMA11	P32842	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MIX23	P38162	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	TRS20	P38334	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MIT1	P40002	666 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YER134C	P40081	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YIR035C	P40579	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SAY1	P53324	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RRT7	Q07829	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MRS4	P23500	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	AVT6	P40074	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	GRX5	Q02784	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	EST3	Q03096	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RCE1	Q03530	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SHH3	Q04487	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RAF1	Q06891	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	FIT3	Q08907	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	TRP1	P00912	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	STF2	P16965	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	HSL1	P34244	1518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YND1	P40009	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	PDR11	P40550	1411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	DAN1	P47178	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.1 ms