RNA–Protein interactions for RNA: YKL202W

YKL202W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL202W, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL202W	YKL202W	RAD9	P14737	1309 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	TRX3	P25372	127 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	UBC8	P28263	218 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YAR064W	P39563	99 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	UPS1	Q05776	175 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YOL024W	Q08172	172 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	ATP20	Q12233	115 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	HFA1	P32874	2273 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	ADE1	P27616	306 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	NTG1	P31378	399 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	CPR5	P35176	225 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	ETR1	P38071	380 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	SBH2	P52871	88 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	GAL83	Q04739	417 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RIF1	P29539	1916 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RRT1	P38192	103 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	NSE4	P43124	402 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	AVO2	Q04749	426 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	ATG41	Q12048	136 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	DAS2	Q12084	232 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	CCW12	Q12127	133 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	APA2	P22108	325 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YBL010C	P32788	280 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	NSG1	P38837	291 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YIL102C	P40488	101 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RTC4	P53850	401 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	AIM34	Q03673	198 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YHP1	Q04116	353 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	GRX8	Q05926	109 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	PGA1	P53896	198 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	NRK1	P53915	240 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	DML1	Q03652	475 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	RIM9	Q04734	239 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	DGK1	Q12382	290 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL202W	YKL202W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	DCV1	P43595	202 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	SOL1	P50278	321 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	CGR1	P53188	120 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	HHT1	P61830	136 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	VPS28	Q02767	242 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	SHH4	Q06236	168 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	HSP30	P25619	332 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	AHC2	P25649	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YKL102C	P34249	101 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	CAF4	P36130	643 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YKR041W	P36134	250 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YJR015W	P47090	510 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	SNO1	Q03144	224 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	GPI17	Q04080	534 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	GRE1	Q08969	168 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	FCY1	Q12178	158 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YCR001W	P25347	104 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	CLG1	P35190	452 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	RFC2	P40348	353 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	POG1	P40473	351 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YDC1	Q02896	317 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.16	□□□□□ -2.38	not detected
YKL202W	YKL202W	MAK31	P23059	88 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	MOB1	P40484	314 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	SED1	Q01589	338 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	KEI1	Q06346	221 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL202W	YKL202W	JIP3	O13555	125 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL202W	YKL202W	RAD6	P06104	172 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL202W	YKL202W	CSH1	P38287	376 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL202W	YKL202W	NVJ1	P38881	321 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL202W	YKL202W	FMP32	P43557	207 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL202W	YKL202W	GRX5	Q02784	150 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL202W	YKL202W	TMA23	Q03525	211 aa		0.15	□□□□□ -2.39

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