RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CYKL063C NSE4P43124 402 aa-0.5□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C MRS1P07266 363 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C COQ1P18900 473 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C RFA3P26755 122 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C IKI1P38874 309 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C SBH1P52870 82 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C YHP1Q04116 353 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C ARG80P07249 177 aa-0.52□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C SHB17P36136 271 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C YKR005CQ02203 525 aa-0.52□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C FCY1Q12178 158 aa-0.52□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C ASF2P32448 525 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C YLR036CQ07986 203 aa-0.53□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C ATG41Q12048 136 aa-0.53□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C YOR015WQ12169 119 aa-0.53□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C ATP20Q12233 115 aa-0.53□□□□□ -2.49
YKL063CYKL063C POG1P40473 351 aa-0.54□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C YMR030W-AQ3E760 96 aa-0.54□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C CCS1P40202 249 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C DGK1Q12382 290 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C NTG1P31378 399 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C RRT1P38192 103 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C FMP23P38231 175 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C TDA4P47153 279 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C DML1Q03652 475 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C DAS2Q12084 232 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C YLR307C-AQ3E825 87 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C LAA1P39526 2014 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C CLG1P35190 452 aa-0.57□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C HHT1P61830 136 aa-0.57□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C YLR031WQ07978 186 aa-0.57□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C NCB2Q92317 146 aa-0.57□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C NUM1Q00402 2748 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C BLM10P43583 2143 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C URA2P07259 2214 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C HTB1P02293 131 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C HTB2P02294 131 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C YNL184CP53876 108 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C IGO2Q9P305 131 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C CPR5P35176 225 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C NSA2P40078 261 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C MSS2P40990 351 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C YGL230CP53074 147 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C RIM9Q04734 239 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C GAL83Q04739 417 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C GIS3Q12418 502 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C TAO3P40468 2376 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL063CYKL063C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C RPL43BP0CX26 92 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C PTC1P35182 281 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C YOR342CQ12182 319 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C YCL012CQ8J0M4 134 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C YLR157W-EP0CF00 54 aa-0.61□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C MMS2P53152 137 aa-0.61□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C MAK31P23059 88 aa-0.63□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C CIN5P40917 295 aa-0.63□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C YOR381W-AQ3E804 55 aa-0.63□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C CBF1P17106 351 aa-0.64□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C PRE1P22141 198 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C MGR2Q02889 113 aa-0.64□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C ARO80Q04052 950 aa-0.64□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C CSF1Q12150 2958 aa-0.65□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C NSG1P38837 291 aa-0.65□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C NRK1P53915 240 aa-0.65□□□□□ -2.51
YKL063CYKL063C KIN28P06242 306 aa-0.66□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C YMR141CP40211 102 aa-0.66□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C HRD1Q08109 551 aa-0.66□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C ADE1P27616 306 aa-0.67□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C TAF2P23255 1407 aa-0.68□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C YLR412C-AQ3E742 68 aa-0.68□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C YBR027CP38220 110 aa-0.69□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C PGA1P53896 198 aa-0.69□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C YOL024WQ08172 172 aa-0.69□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C SNF2P22082 1703 aa-0.69□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C HSP30P25619 332 aa-0.7□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C YDL157CQ12082 118 aa-0.7□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C MATALPHA2P0CY08 210 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C HMLALPHA2P0CY09 210 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C MOB1P40484 314 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C VPS28Q02767 242 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C SEN15Q04675 128 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C YPR127WQ06494 345 aa-0.71□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C AIM34Q03673 198 aa-0.72□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C VAM10Q08474 114 aa-0.72□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
YKL063CYKL063C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.73□□□□□ -2.53not detected
YKL063CYKL063C TRX3P25372 127 aa-0.73□□□□□ -2.53
YKL063CYKL063C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.73□□□□□ -2.53not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.3 ms