RNA–Protein interactions for RNA: YJL174W

KRE9, Transcript of Glycoprotein involved in cell wall beta-glucan assembly, yeast

Gene KRE9, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	YJL174W	BET1	P22804	142 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KRE9	YJL174W	FMP23	P38231	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KRE9	YJL174W	ICE2	P40499	491 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KRE9	YJL174W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KRE9	YJL174W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KRE9	YJL174W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	Q0255	P03881	472 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YCR023C	P25351	611 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	UBC8	P28263	218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YHL026C	P38740	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YHR125W	P38831	101 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	ARR2	Q06597	130 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	IES4	Q08561	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	MCP1	Q12106	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	HIS3	P06633	220 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	RAD10	P06838	210 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	UTH1	P36135	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	AIM2	P39721	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	TDA4	P47153	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	LDB16	P25587	256 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	TKL2	P33315	681 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	ECO1	P43605	281 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YGL088W	P53151	121 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YGR026W	P53217	278 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YGR042W	P53227	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	APJ1	P53940	528 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	LAA1	P39526	2014 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	CDC8	P00572	216 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	SPO13	P23624	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	UPS2	P35200	230 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	PRM10	P42946	383 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YER188W	P40103	239 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	XPT1	P47165	209 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	YGL101W	P53144	215 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	TRM12	Q04235	462 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	AKR2	Q12013	749 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	CCA1	P21269	546 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	RFC2	P40348	353 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	SAS5	Q99314	248 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KRE9	YJL174W	OCH1	P31755	480 aa		4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	GON7	P46984	123 aa		4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	SNX4	P47057	423 aa		4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	ATP15	P21306	62 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	SER2	P42941	309 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	MNN5	P46982	586 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YGL204C	P53089	101 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	ECM11	Q04110	302 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.01	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	HAP2	P06774	265 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	MID2	P36027	376 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	SLM6	P38343	150 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	NSG1	P38837	291 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	AVT2	P39981	480 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YIR035C	P40579	254 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	DSK2	P48510	373 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	RAV2	Q03956	351 aa		4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	TIM9	O74700	87 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	VMA11	P32842	164 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	CYC2	P38909	366 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YEA4	P40004	342 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	TTI2	P47168	421 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	SCW10	Q04951	389 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	MRPL17	P36528	281 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	CTR2	P38865	189 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YER134C	P40081	178 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	MOB1	P40484	314 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	APQ12	P40532	138 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	DGK1	Q12382	290 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	PEX34	P25584	144 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KRE9	YJL174W	YKR032W	P36127	104 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.2 ms