RNA–Protein interactions for RNA: YHR196W

UTP9, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP9, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP9	YHR196W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	ETR1	P38071	380 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	IRC22	P40006	225 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	YGL230C	P53074	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	FSH2	Q05015	223 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	SCP1	Q08873	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	YCR022C	P25620	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	IMP1	P28627	190 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
UTP9	YHR196W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	YBT1	P32386	1661 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UTP9	YHR196W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	RPB11	P38902	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YJL213W	P40896	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	GON7	P46984	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	SBH1	P52870	82 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	RSM27	P53305	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	LPP1	Q04396	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	HUT1	Q12520	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	SPT14	P32363	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
UTP9	YHR196W	NSG1	P38837	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	AVT2	P39981	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	CSE2	P33308	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YBR090C	P38253	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	CHS7	P38843	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	BUD25	P85052	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	GTT2	Q12390	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	GAS3	Q03655	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	SCW10	Q04951	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	ERG2	P32352	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	PHO89	P38361	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	NSE4	P43124	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	IZH2	Q12442	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	KRE5	P22023	1365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	REP2	P03872	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	PEX4	P29340	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	SNO3	P43544	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	CLD1	P53264	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	ELC1	Q03071	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	FMP42	Q04991	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	AHT1	P29589	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YIL012W	P40551	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YGR015C	P53208	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	TVP18	Q04767	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	PDR11	P40550	1411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	VMR1	P38735	1592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	ATR1	P13090	542 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	ZRT3	P34240	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YKR073C	P36153	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	OMA1	P36163	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	FIS1	P40515	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YGL262W	P53054	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	YGL193C	P53097	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	TIM22	Q12328	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	IML1	P47170	1584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP9	YHR196W	RSF2	P46974	1380 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	RPB5	P20434	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	BET1	P22804	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	RCN1	P36054	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SKG1	P36169	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	ERV15	P38312	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	AVT6	P40074	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	STB1	P42845	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	EAF6	P47128	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YNR062C	P53748	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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