RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YJL118WP47022 219 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YJR012CP47087 207 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C VPS28Q02767 242 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MIX17Q03667 156 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YPD1Q07688 167 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PAM18Q07914 168 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C HRD1Q08109 551 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BOL1Q3E793 110 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOS1Q3E834 85 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C CCW14O13547 238 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C VPS63O13549 108 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C STF2P16965 84 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PHO85P17157 305 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MAG1P22134 296 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SEC22P22214 214 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MRS4P23500 304 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ERV1P27882 189 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SRY1P36007 326 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YKL162CP36052 402 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ECM31P38122 312 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C LSM12P38828 187 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C NOP16P40007 231 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YER188WP40103 239 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YJR056CP47115 236 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ARP3P47117 449 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YIP1P53039 248 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PNC1P53184 216 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MRPL50P53724 139 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YIF1P53845 314 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C GPI15P53961 229 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C STD1Q02794 444 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PLP1Q04004 230 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RRT7Q07829 113 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C AEP3Q12089 606 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FCY1Q12178 158 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ATO3Q12359 275 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ATG5Q12380 294 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ATG31Q12421 196 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YJR112W-AQ3E743 109 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ISN1Q99312 450 aa1.77□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C HTB1P02293 131 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C TOM40P23644 387 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RAD23P32628 398 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PDC2P32896 925 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C VMA22P38784 181 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C GEP4P38812 185 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YEA6P39953 335 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SWM2P40342 146 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RFC2P40348 353 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DFG10P40526 253 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C TAD2P47058 250 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ECM27P47144 725 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C JAC1P53193 184 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C CRH1P53301 507 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ACT1P60010 375 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DID2P69771 204 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DYN2Q02647 92 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YMR166CQ03829 368 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FSH2Q05015 223 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MCH1Q07376 486 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YNG1Q08465 219 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YPL264CQ08980 353 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C JID1Q12350 301 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RAX2Q12465 1220 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa1.76□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YBR085C-AO43137 85 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C URA5P13298 226 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YKR045CP36138 183 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ATP3P38077 311 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C WSS1P38838 269 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YEA4P40004 342 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C NSA2P40078 261 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C COX15P40086 486 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C LST8P41318 303 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C AGX1P43567 385 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C WWM1P43582 211 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGR050CP53231 118 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C HCH1P53834 153 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PDR17P53844 350 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DUG3P53871 357 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C EST3Q03096 181 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YMR082CQ04276 118 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C COA4Q05809 96 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ANT1Q06497 328 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C BER1Q06688 274 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C NDE2Q07500 545 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGL258W-AQ3E740 77 aa1.75□□□□□ -2.13
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