RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	ECM27	P47144	725 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YGL262W	P53054	175 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YNR064C	P53750	290 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RTR2	Q12378	196 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PRM4	Q12498	284 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ISN1	Q99312	450 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	CYC3	P06182	269 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	STF2	P16965	84 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	APA2	P22108	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ERG2	P32352	222 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	CPR5	P35176	225 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YPC1	P38298	316 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	CUE1	P38428	203 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YHL044W	P38727	235 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	VMA22	P38784	181 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SSO2	P39926	295 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PCL7	P40186	285 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YIR035C	P40579	254 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	MRPL50	P53724	139 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ECM18	Q04623	453 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YCT1	Q12235	531 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	BBP1	Q12365	385 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	DGK1	Q12382	290 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	TFC7	Q12415	435 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SEC22	P22214	214 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	IES6	P32617	166 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	GPI18	P38211	433 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	IKI1	P38874	309 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SAS2	P40963	338 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YHC3	P47040	408 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	TTI2	P47168	421 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	VPS28	Q02767	242 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PLP1	Q04004	230 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ARR2	Q06597	130 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YFH1	Q07540	174 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	CSI2	Q08054	341 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	GEP5	Q12393	293 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ROX3	P25046	220 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ERV15	P38312	142 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	GEP4	P38812	185 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SIM1	P40472	476 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SOR2	Q07786	357 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RRT7	Q07829	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YNG1	Q08465	219 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YMR31	P19955	123 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	MRS4	P23500	304 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YCL042W	P25572	119 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SPS18	P32572	300 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	TCA17	P32613	152 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	VMA11	P32842	164 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PDC2	P32896	925 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	SWM2	P40342	146 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RFC2	P40348	353 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YJL118W	P47022	219 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YJR012C	P47087	207 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YGL114W	P53134	725 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	LPP1	Q04396	274 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	COA4	Q05809	96 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YPD1	Q07688	167 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	HRD1	Q08109	551 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ATG5	Q12380	294 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YEA6	P39953	335 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	TAD2	P47058	250 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ABM1	P47146	123 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	JAC1	P53193	184 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ORM1	P53224	222 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	GPI15	P53961	229 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	DID2	P69771	204 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	MIX17	Q03667	156 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YML108W	Q03759	105 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ANT1	Q06497	328 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	PAM18	Q07914	168 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YOS1	Q3E834	85 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ERV1	P27882	189 aa		3.27	□□□□□ -1.89

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