RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C IRC22P40006 225 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YJR015WP47090 510 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C NRG1Q03125 231 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MCM21Q06675 368 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C SOG2Q08817 791 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YBR255C-AQ3E776 120 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C PMR1P13586 950 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C VMA16P23968 213 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RIB7P33312 244 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RRT1P38192 103 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YBR137WP38276 179 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C OTU1P43558 301 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YGR018CP53211 109 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C GRX3Q03835 250 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C HRD1Q08109 551 aa2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C CMC1P36064 111 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RTT105P40063 208 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YGR042WP53227 271 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YGR050CP53231 118 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C TOM7P53507 60 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C DYN2Q02647 92 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C PBA1Q05778 276 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C LDS2Q08218 356 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RAD28Q12021 506 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C CRC1Q12289 327 aa2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C GCN4P03069 281 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YHR213WP0CI67 198 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C URA6P15700 204 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YCR022CP25620 114 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MIT1P40002 666 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YIR035CP40579 254 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C SYS1P41544 203 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C FMP41P53889 259 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C EST3Q03096 181 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C ATG5Q12380 294 aa2.49□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YCR025CP25352 136 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MRPL4P36517 319 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C NVJ1P38881 321 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C VHS2P40463 436 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C ERP6P53198 216 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C VHT1P53241 593 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C ATP23P53722 227 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YOL160WQ08321 113 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RRT15Q3E811 62 aa2.48□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C HIS3P06633 220 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.47□□□□□ -2.01not detected
SUP53tL(CAA)C AHC2P25649 128 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C AGA1P32323 725 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C COS8P38723 381 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C IMP2P46972 177 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MED4Q12343 284 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YDR010CQ12426 110 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C PRM4Q12498 284 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C YGL258W-AQ3E740 77 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C UBA3Q99344 299 aa2.47□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C MRP10O75012 95 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C YDR034C-AP0C289 58 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C ATR1P13090 542 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C DDR48P18899 430 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C ZRC1P20107 442 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data2.46□□□□□ -2.02not detected
SUP53tL(CAA)C YBL071CP38185 102 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C BDH1P39714 382 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C CAT5P41735 233 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C DSK2P48510 373 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C YAP1802P53309 568 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C SPC24Q04477 213 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C RTT103Q05543 409 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C YPL264CQ08980 353 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C ATG41Q12048 136 aa2.46□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C URA5P13298 226 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C ERS1P17261 260 aa2.45□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C FMT1P32785 401 aa2.45□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C AVT5P38176 459 aa2.45□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C SIT1P39980 628 aa2.45□□□□□ -2.02
SUP53tL(CAA)C LOA1Q06508 300 aa2.45□□□□□ -2.02
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