RNA–Protein interactions for RNA: YMR275C

BUL1, Transcript of Ubiquitin-binding component of the Rsp5p E3-ubiquitin ligase complex, yeast

Gene BUL1, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUL1	YMR275C	SNA4	Q07549	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	COX19	Q3E731	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	CDC50	P25656	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	ALG14	P38242	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SHG1	P38337	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	DYN2	Q02647	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TMA23	Q03525	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	LDS1	P31379	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	MIA40	P36046	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	WSS1	P38838	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SNO1	Q03144	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	VPS63	O13549	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	ISC10	P32645	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	YBR292C	P38357	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	ERG25	P53045	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	ARR3	Q06598	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	COX15	P40086	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	YMR31	P19955	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	RTS2	P40962	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SOR2	Q07786	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	MRS3	P10566	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SIP1	P32578	815 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	HCH1	P53834	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	SPC25	P40014	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	CTR3	Q06686	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUL1	YMR275C	QDR3	P38227	689 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YJR015W	P47090	510 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	DAL4	Q04895	635 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	NDE2	Q07500	545 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	ATO3	Q12359	275 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	AHT1	P29589	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	PMU1	P36069	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YGR269W	P40326	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YIL024C	P40543	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YAP1802	P53309	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	CAF40	P53829	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YHP1	Q04116	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	POM34	Q12445	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YBR184W	P38299	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YJL118W	P47022	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YGL114W	P53134	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YGR151C	P53287	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	CSI2	Q08054	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	FCY1	Q12178	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	WSC3	Q12215	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	IES6	P32617	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	DER1	P38307	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	PTC7	P38797	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YIL012W	P40551	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	NCA3	P46955	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	SBH2	P52871	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	PAU4	P53427	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	JID1	Q12350	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	GPI18	P38211	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YGR045C	P53229	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	YNL234W	P53857	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	DMA2	P53924	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUL1	YMR275C	POS5	Q06892	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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