RNA–Protein interactions for RNA: YMR255W

GFD1, Transcript of Coiled-coiled protein of unknown function, yeast

Gene GFD1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD1	YMR255W	FIT1	Q04433	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	DXO1	Q06349	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RFU1	Q08003	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	FRE8	Q12209	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SAG1	P20840	650 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	APA2	P22108	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	CMC1	P36064	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
GFD1	YMR255W	SLM6	P38343	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	GTT1	P40582	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MEH1	Q02205	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	IZH2	Q12442	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	COA2	Q3E823	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MRS3	P10566	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SWD3	P38123	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	PRM5	P40476	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	NSE4	P43124	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MOG1	P47123	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	TIM21	P53220	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YNR066C	P53752	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SPS4	P09937	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MSI1	P13712	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YCR025C	P25352	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	CLB6	P32943	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YUH1	P35127	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MCH2	P36032	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RIB5	P38145	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YBR292C	P38357	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MTC6	P38849	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	HXT14	P42833	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	TSA2	Q04120	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	GMC1	Q04399	608 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	IMP1	P28627	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	MRPS5	P33759	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	MRPL39	P36533	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	SDH4	P37298	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	SLM1	P40485	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YIL029C	P40538	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	VMA21	P41806	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	DAN1	P47178	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	PIN3	Q06449	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	PRR2	Q12310	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	AGC1	Q12482	902 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	ATG15	P25641	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	ERV1	P27882	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	MRPL4	P36517	319 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	ERG25	P53045	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	PAM18	Q07914	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YCR007C	P25354	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	UPS2	P35200	230 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YER084W	P40057	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	FLX1	P40464	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	PHS1	P40857	217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	BNS1	P50084	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YGL260W	P53056	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	YIP5	P53108	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	RCE1	Q03530	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	FSH2	Q05015	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GFD1	YMR255W	ATG5	Q12380	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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