RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeastyeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2YML013W ZRT1P32804 376 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PMU1P36069 295 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PAU5P43575 122 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PRY1P47032 299 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W TIS11P47977 285 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PCP1P53259 346 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W CPD1P53314 239 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W SNO2P53823 222 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YNL184CP53876 108 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YNL140CP53910 189 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YLR030WQ07967 263 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YOR385WQ08909 290 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W ERV2Q12284 196 aa4.81□□□□□ -1.64
UBX2YML013W AIM17P23180 465 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YHL044WP38727 235 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W TRR2P38816 342 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W SPC25P40014 221 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YFR057WP43625 151 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W LST7P53237 242 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YPL077CQ02831 240 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W HUT1Q12520 339 aa4.8□□□□□ -1.64
UBX2YML013W NOP1P15646 327 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W BGL2P15703 313 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W RPS20P38701 121 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YIL060WP40519 144 aa4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W CDC1P40986 491 aa4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W SRL2Q12020 392 aa4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PRR2Q12310 699 aa4.79□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PAI3P01094 68 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W ANB1P19211 157 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W ECM15P35195 104 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YFL015CP43578 164 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W RCE1Q03530 315 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YLR036CQ07986 203 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YDL177CQ12257 170 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YIL067CP40514 678 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W IKS1P47042 667 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W PGA1P53896 198 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W YOR015WQ12169 119 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W IZH2Q12442 317 aa4.78□□□□□ -1.64
UBX2YML013W CYC7P00045 113 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YMC1P32331 307 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ERG24P32462 438 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MKK1P32490 508 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W UPS2P35200 230 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W DRE2P36152 348 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MIX23P38162 196 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SNU13P39990 126 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W DLS1P40366 167 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W PHS1P40857 217 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W HHT1P61830 136 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W NDD1Q08887 554 aa4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPL28P02406 149 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W DOG1P38774 246 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W CIN2P46670 268 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YLR460CP54007 376 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ELC1Q03071 99 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ORT1Q12375 292 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RAX2Q12465 1220 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W CSR2Q12734 1121 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPB5P20434 215 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W TRR1P29509 319 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W FMT1P32785 401 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data4.76□□□□□ -1.65not detected
UBX2YML013W YIA6P40556 373 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YCH1P42937 148 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W KEG1P43614 200 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SBH2P52871 88 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YGL235WP53071 178 aa4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W DET1Q99288 334 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBX2YML013W CPA1P07258 411 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W TIR1P10863 254 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YKL187CP34231 750 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W THI80P35202 319 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W DER1P38307 211 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W PAC2P39937 518 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W HEM14P40012 539 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SMD3P43321 101 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W VPS25P47142 202 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YGR035CP53222 116 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W GRX8Q05926 109 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SEI1Q06058 285 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MCH4Q08268 501 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YDL157CQ12082 118 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YLR122CQ12312 125 aa4.75□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MBF1O14467 151 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YFL068WP0CX99 160 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YLL066W-AP0CY00 160 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YLL067W-AP0CY01 160 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.9 ms