RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	QCR9	P22289	66 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SIP1	P32578	815 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YRF1-4	YLR466W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	LAC1	P28496	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TRS20	P38334	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RMD6	P39975	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	VMA21	P41806	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	NSE4	P43124	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TIM21	P53220	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	MRPL33	P20084	86 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU13	P38725	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU4	P53427	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU10	Q03050	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ASM4	Q05166	528 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU20	Q08322	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PRE3	P38624	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	COA2	Q3E823	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YKL075C	P36083	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	WSS1	P38838	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
YRF1-4	YLR466W	SBH2	P52871	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	MSC3	Q05812	728 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PRR2	Q12310	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ELO2	P25358	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	HMX1	P32339	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YGR026W	P53217	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	EOS1	P53938	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	DXO1	Q06349	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	VPS63	O13549	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ROX3	P25046	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	QDR3	P38227	689 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	GON7	P46984	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	SOR2	Q07786	357 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YMR31	P19955	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	CDC50	P25656	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	POP5	P28005	173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ECM14	P38836	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	GLC8	P41818	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YNL046W	P53956	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ARR2	Q06597	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PHO85	P17157	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ATP10	P18496	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	MGA1	P53050	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	DAD3	P69850	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	MRPS9	P38120	278 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YBR184W	P38299	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PTC7	P38797	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	FLO5	P38894	1075 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
YRF1-4	YLR466W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YGR050C	P53231	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YNL092W	P53934	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	CSM4	Q08955	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	MRS4	P23500	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	REC104	P33323	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	CUE1	P38428	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	PIR5	P46999	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	APS2	Q00381	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ATC1	Q04005	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ATG15	P25641	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	GEP5	Q12393	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	RPL39	P04650	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	YOX1	P34161	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRF1-4	YLR466W	DAD2	P36162	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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