RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	RFU1	Q08003	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	COA2	Q3E823	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CDC26	P14724	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PDX1	P16451	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MXR2	P25566	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	AHT1	P29589	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TCA17	P32613	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MNS1	P32906	549 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	OM14	P38325	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	FLO5	P38894	1075 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPB11	P38902	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PAC2	P39937	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SAE3	P89114	91 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SKO1	Q02100	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATG5	Q12380	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATG40	Q99325	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RIP1	P08067	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	STE4	P18851	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SPO13	P23624	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HSP150	P32478	413 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPB7	P34087	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	FLO9	P39712	1322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YND1	P40009	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YER010C	P40011	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	COX15	P40086	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SEN15	Q04675	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	STP3	Q05937	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SEI1	Q06058	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HRD1	Q08109	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HUT1	Q12520	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	AGA2	P32781	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	FIG1	P38224	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CUE1	P38428	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	UIP3	P39547	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CYB5	P40312	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YPS6	P40583	537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	GPI2	P46961	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YGR149W	P48236	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YAP1802	P53309	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	DAD3	P69850	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MRP51	Q02950	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	TMA10	Q06177	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	POM33	Q12164	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	ERV2	Q12284	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	VMA16	P23968	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YCR025C	P25352	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MIA40	P36046	403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	GAT2	P40209	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YIL029C	P40538	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CIS3	P47001	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MSY1	P48527	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	TRM9	P49957	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	LST7	P53237	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
YKR041W	YKR041W	SWM1	Q12379	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	LAS17	Q12446	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	COX5B	P00425	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	HAP3	P13434	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	COQ3	P27680	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CWP1	P28319	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YKL102C	P34249	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	UBS1	P38290	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SHO1	P40073	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	REE1	P40893	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CUP9	P41817	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SNO3	P43544	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	BLM10	P43583	2143 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.8 ms