RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	CNB1	P25296	175 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	RPB7	P34087	171 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YEL008W	P40001	126 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YER134C	P40081	178 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	UBC12	P52491	188 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	UPS3	Q04006	179 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	BNA7	Q04066	261 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	GGA1	Q06336	557 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	COX8	P04039	78 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	TAF14	P35189	244 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SER2	P42941	309 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	PGA2	P53903	129 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YLR460C	P54007	376 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SHH3	Q04487	196 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	RNH202	Q05635	350 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	FIT2	Q08906	153 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	HTB2	P02294	131 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ARG80	P07249	177 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ARO7	P32178	256 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	UGX2	P32772	223 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SFK1	P35735	353 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MTW1	P39731	289 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YLR036C	Q07986	203 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MRS1	P07266	363 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	PHO85	P17157	305 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	PAM17	P36147	197 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	CUP9	P41817	306 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	GIS3	Q12418	502 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MGT1	P26188	188 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	UBC8	P28263	218 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MRPL15	P36523	253 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MMS2	P53152	137 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YNL033W	P53964	284 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MET31	Q03081	177 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	TIR1	P10863	254 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SNF4	P12904	322 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SEN2	P16658	377 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	CBF1	P17106	351 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	AHT1	P29589	182 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	TDA4	P47153	279 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	RNH1	Q04740	348 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YCR023C	P25351	611 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YBR242W	P38331	238 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	SPC25	P40014	221 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	YNL184C	P53876	108 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	PIR1	Q03178	341 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	VPS71	Q03433	280 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	NAT3	Q06504	195 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	GET4	Q12125	312 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YJL135W	YJL135W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	STF2	P16965	84 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	NTG1	P31378	399 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	YHL037C	P38733	133 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	YIL102C	P40488	101 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	YFL051C	P43552	160 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	YFL019C	P43576	117 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	SBH2	P52871	88 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	FYV12	Q08559	129 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YJL135W	YJL135W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36

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