RNA–Protein interactions for RNA: YFL018C

LPD1, Transcript of Dihydrolipoamide dehydrogenase, yeastyeast

Gene LPD1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPD1YFL018C POX1P13711 748 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C COX10P21592 462 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C TRX3P25372 127 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C YJU3P28321 313 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C MRPL16P38064 232 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C MOH1P38191 138 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C ARC40P38328 384 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C TEM1P38987 245 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C GPP1P41277 250 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C YML079WQ03629 201 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C SYM1Q06563 197 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C STP4Q07351 490 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C ENV9Q08651 330 aa6.96□□□□□ -1.29
LPD1YFL018C YPR096CO13587 100 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C SEC11P15367 167 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YKL107WP34251 309 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C ATX1P38636 73 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C UME6P39001 836 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C CRZ1P53968 678 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C LIP2Q06005 328 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C ODC2Q99297 307 aa6.96□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C CYC3P06182 269 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C STE7P06784 515 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C DPM1P14020 267 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YGL010WP25338 174 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C TIR2P33890 251 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C VID24P38263 362 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C MRPL19P53875 158 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C SLG1P54867 378 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C BUD25P85052 153 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YPR098CQ06089 161 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YOL073CQ08232 322 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C WSC3Q12215 556 aa6.95□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C DED1P06634 604 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C CUP2P15315 225 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C CDC43P18898 376 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C INM1P38710 295 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YER076CP40049 302 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C SFH5P47008 294 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C VPS25P47142 202 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C SCS3P53012 380 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YPR071WQ12346 211 aa6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C NUD1P32336 851 aa6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C CMC1P36064 111 aa6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C SDS24P38314 527 aa6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YFL054CP43549 646 aa6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C BAT2P47176 376 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C GRX8Q05926 109 aa6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C ATO3Q12359 275 aa6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C GLN3P18494 730 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C ADK2P26364 225 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C SPS18P32572 300 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C IXR1P33417 597 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YKL071WP36086 256 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C MIC12P38341 106 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C ERG28P40030 148 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C RSF1Q05043 376 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C POM34Q12445 299 aa6.92□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C FMP49A0A023PZB3 126 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C NFS1P25374 497 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C IDH2P28241 369 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C HXT4P32467 576 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YJL213WP40896 331 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C MID1P41821 548 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YJR124CP47159 448 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YOL162WP0CF19 215 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YAR066WP0CX18 203 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YHR214WP0CX19 203 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C FCY2P17064 533 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C MKK1P32490 508 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C GPX1P36014 167 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C VBA2P38358 474 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C TIF34P40217 347 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C NUP53Q03790 475 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YMR082CQ04276 118 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C MRPL1Q04599 285 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C YDL242WQ07746 117 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C USB1Q12208 290 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C UTP23Q12339 254 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C PEX11Q12462 236 aa6.91□□□□□ -1.3
LPD1YFL018C RAD6P06104 172 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C MRS1P07266 363 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C YER039C-AP0CD97 72 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C ERG8P24521 451 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C ERG4P25340 473 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C AZF1P41696 914 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C OST2P46964 130 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C NRG1Q03125 231 aa6.9□□□□□ -1.31
LPD1YFL018C RIM9Q04734 239 aa6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 228.4 ms