RNA–Protein interactions for RNA: YBR237W

PRP5, Transcript of RNA helicase in the DEAD-box family, yeast

Gene PRP5, Length 2,550 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP5	YBR237W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YBR242W	P38331	238 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YEL008W	P40001	126 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YER085C	P40058	173 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	CUP9	P41817	306 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	IRC18	P47056	224 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MPC3	P53311	146 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	IRC23	Q08416	157 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	DGK1	Q12382	290 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	COX8	P04039	78 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	COQ1	P18900	473 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	OCH1	P31755	480 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YER134C	P40081	178 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MER1	P16523	270 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SPS18	P32572	300 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YNL194C	P40169	301 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YFL051C	P43552	160 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MGA1	P53050	456 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	CCW12	Q12127	133 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	NCB2	Q92317	146 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	INO80	P53115	1489 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SEN2	P16658	377 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MTW1	P39731	289 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	DCV1	P43595	202 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SED1	Q01589	338 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PIR1	Q03178	341 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	FIT2	Q08906	153 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	NTG1	P31378	399 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PAM17	P36147	197 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RAD17	P48581	401 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	FIT1	Q04433	528 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	GET4	Q12125	312 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	CNB1	P25296	175 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YCR023C	P25351	611 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	ERG28	P40030	148 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SER2	P42941	309 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YJR015W	P47090	510 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	VPS71	Q03433	280 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RNH202	Q05635	350 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PRM3	Q08931	133 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.1	□□□□□ -2.39	not detected
PRP5	YBR237W	STF2	P16965	84 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YHL037C	P38733	133 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SBH1	P52870	82 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PET191	Q02772	108 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SNF4	P12904	322 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YBL010C	P32788	280 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	OTU1	P43558	301 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YNL033W	P53964	284 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	TMA23	Q03525	211 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	ELP6	Q04868	273 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	HRD1	Q08109	551 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	CLG1	P35190	452 aa		0.09	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	SPC25	P40014	221 aa		0.09	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.09	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.09	□□□□□ -2.39
PRP5	YBR237W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.09	□□□□□ -2.4
PRP5	YBR237W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
PRP5	YBR237W	HTB2	P02294	131 aa		0.09	□□□□□ -2.4
PRP5	YBR237W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
PRP5	YBR237W	MAK31	P23059	88 aa		0.09	□□□□□ -2.4
PRP5	YBR237W	MGT1	P26188	188 aa		0.09	□□□□□ -2.4

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