RNA–Protein interactions for RNA: Q0120

BI4, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI4	Q0120	YEL008W	P40001	126 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	SER2	P42941	309 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	IRC23	Q08416	157 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	DAD4	P69851	72 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	CBF1	P17106	351 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YMR007W	Q03675	126 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YOL014W	Q08110	124 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	FIT2	Q08906	153 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	COX8	P04039	78 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YCL042W	P25572	119 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YER134C	P40081	178 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	DYN3	Q04949	312 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	FUS2	Q05670	677 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	PHO85	P17157	305 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	AIM2	P39721	246 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	HPA3	P39979	161 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	MMS2	P53152	137 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	ECM4	P36156	370 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YMR295C	Q03559	197 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	YPR013C	Q12145	317 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI4	Q0120	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	NAT3	Q06504	195 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	QCR7	P00128	127 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YPK2	P18961	677 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	RPB7	P34087	171 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	PAM17	P36147	197 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	SHH3	Q04487	196 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	TIR1	P10863	254 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	NTG1	P31378	399 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	MTW1	P39731	289 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	UBC12	P52491	188 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YNL184C	P53876	108 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YNL033W	P53964	284 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YLR460C	P54007	376 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	MGT1	P26188	188 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	FMP23	P38231	175 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	ARO80	Q04052	950 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YMR253C	Q04835	414 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YLR031W	Q07978	186 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	IGO2	Q9P305	131 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YFL019C	P43576	117 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	TDA4	P47153	279 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	UPS3	Q04006	179 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	GET4	Q12125	312 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	ARO7	P32178	256 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	CUP9	P41817	306 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	JIP3	O13555	125 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	SNF4	P12904	322 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	SFK1	P35735	353 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	SPC25	P40014	221 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	YLR036C	Q07986	203 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI4	Q0120	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	VPS71	Q03433	280 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	LCL2	Q08045	131 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	SEN2	P16658	377 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	AIM36	Q03798	255 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YDR391C	Q04170	232 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	FYV12	Q08559	129 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	MET31	Q03081	177 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YOL024W	Q08172	172 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YPR203W	Q08994	102 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	MRPL15	P36523	253 aa		0.75	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.75	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YCR023C	P25351	611 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	ADE1	P27616	306 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	MPM1	P40364	252 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	ATP20	Q12233	115 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	RAD9	P14737	1309 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	STP22	P25604	385 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YBR242W	P38331	238 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YGL235W	P53071	178 aa		0.74	□□□□□ -2.29

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