RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	WSS1	P38838	269 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU5	P43575	122 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	OST3	P48439	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	FYV7	Q12247	151 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SPO13	P23624	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	VMA16	P23968	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	STP22	P25604	385 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YHR210C	P38893	341 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YJL193W	P39542	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	IRC22	P40006	225 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	GWT1	P47026	490 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YGR149W	P48236	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU4	P53427	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YDC1	Q02896	317 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	MIM1	Q08176	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ATG5	Q12380	294 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	COA2	Q3E823	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	CKA1	P15790	372 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	STE4	P18851	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	DAL82	P21705	255 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	AFG1	P32317	509 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU13	P38725	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	UIP3	P39547	235 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	GAT2	P40209	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	GLC8	P41818	229 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ATG27	P46989	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YJR012C	P47087	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SAE3	P89114	91 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	STD1	Q02794	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU10	Q03050	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	TSA2	Q04120	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU20	Q08322	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ISA2	Q12425	185 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SCEI	P03882	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ATP5	P09457	212 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	MAK32	P23060	363 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PCL1	P24867	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YCR025C	P25352	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ERG2	P32352	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	REC114	P32841	428 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YBR096W	P38256	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ATF1	P40353	525 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	XBP1	P40489	647 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ERG25	P53045	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	ATC1	Q04005	294 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	CTS2	Q06350	511 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	IRC19	Q07843	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	POM33	Q12164	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	PRR2	Q12310	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	YOP1	Q12402	180 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPT4	YOR259C	IRA1	P18963	3092 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	MDH2	P22133	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	COQ3	P27680	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CUE1	P38428	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HSP10	P38910	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	UME6	P39001	836 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SNO3	P43544	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	DAD3	P69850	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	MRP51	Q02950	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	GIS1	Q03833	894 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	MCH4	Q08268	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	COX1	P00401	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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