RNA–Protein interactions for RNA: YOR048C

RAT1, Transcript of Nuclear 5' to 3' single-stranded RNA exonuclease, yeast

Gene RAT1, Length 3,021 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAT1	YOR048C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	AKR2	Q12013	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	TMA17	Q12513	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	YER010C	P40011	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	PCL7	P40186	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	OST3	P48439	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	RCE1	Q03530	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAT1	YOR048C	SPC25	P40014	221 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	HCH1	P53834	153 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	NIS1	P53939	407 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	NAT5	Q08689	176 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	WTM2	Q12206	467 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YLR358C	O13565	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAM17	P36147	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	QDR3	P38227	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	REE1	P40893	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RPN14	P53196	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	API2	Q04413	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	IZH2	Q12442	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SOL3	P38858	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU4	P53427	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MSC3	Q05812	728 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	FRE8	Q12209	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	FCY2	P17064	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	AHT1	P29589	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YMR262W	P38430	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU15	P40585	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	LST7	P53237	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	HPF1	Q05164	967 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU13	P38725	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	DMA2	P53924	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	DAD3	P69850	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RSM23	Q01163	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU10	Q03050	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YPD1	Q07688	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU20	Q08322	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RNH203	Q12338	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	GEP5	Q12393	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MRS3	P10566	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	VMA3	P25515	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MKK2	P32491	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MCH2	P36032	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SHG1	P38337	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SLM6	P38343	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PEX7	P39108	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	ATG27	P46989	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RIM9	Q04734	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	ATX2	Q12067	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	AVT5	P38176	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	HSP10	P38910	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MED7	Q08278	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SCEI	P03882	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	STE4	P18851	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MRPL44	P19956	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MTC6	P38849	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	GEP7	P53171	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	DYN2	Q02647	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	SDC1	Q03323	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	COQ11	Q05892	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	TRS20	P38334	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	POP2	P39008	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	MGA1	P53050	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	PDR17	P53844	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	RAF1	Q06891	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	POM34	Q12445	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	YLR302C	O13544	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAT1	YOR048C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected

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