RNA–Protein interactions for RNA: YMR255W

GFD1, Transcript of Coiled-coiled protein of unknown function, yeast

Gene GFD1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD1	YMR255W	REE1	P40893	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	MOB2	P43563	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	AGX1	P43567	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	GWT1	P47026	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	AVT4	P50944	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	HHO1	P53551	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YCT1	Q12235	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	CKA1	P15790	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	UFD1	P53044	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	PDX1	P16451	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	SEC62	P21825	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	MDH2	P22133	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	MSK1	P32048	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	FIG1	P38224	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	IKI1	P38874	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YEA6	P39953	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	MRX5	P47007	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YJL016W	P47072	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	YNR048W	P53740	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	APJ1	P53940	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	GPI15	P53961	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	VPS28	Q02767	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	SDC1	Q03323	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	AKR2	Q12013	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	MED4	Q12343	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	HUT1	Q12520	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	FLO9	P39712	1322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GFD1	YMR255W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
GFD1	YMR255W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	PEX4	P29340	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YBR096W	P38256	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	POP2	P39008	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SPC25	P40014	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	POG1	P40473	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SNO1	Q03144	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MIX14	Q04341	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MRS4	P23500	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	OCH1	P31755	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SHG1	P38337	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YEA4	P40004	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	PGD1	P40356	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YJR056C	P47115	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SSN8	P47821	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SOL1	P50278	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MDM30	Q05930	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YPD1	Q07688	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	COX19	Q3E731	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	DAL82	P21705	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ERG2	P32352	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	REC114	P32841	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RPB7	P34087	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MBB1	P39534	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RFC2	P40348	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ECO1	P43605	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YGR026W	P53217	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MRP51	Q02950	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	DCS1	Q06151	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YCR101C	P25607	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	MNS1	P32906	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ERV15	P38312	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	IKS1	P47042	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YJR012C	P47087	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	SKO1	Q02100	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	ADD37	Q03233	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	TMA23	Q03525	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFD1	YMR255W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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