RNA–Protein interactions for RNA: YKL208W

CBT1, Transcript of Protein involved in 5' RNA end processing, yeast

Gene CBT1, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBT1	YKL208W	YLR460C	P54007	376 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	LPP1	Q04396	274 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
CBT1	YKL208W	ATG22	P25568	528 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	IRC22	P40006	225 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	YIL059C	P40520	121 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	AIM25	P47140	327 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	YGR026W	P53217	278 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	YGR050C	P53231	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	RAD10	P06838	210 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	QCR2	P07257	368 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	SNF4	P12904	322 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	PTM1	P32857	523 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	POP4	P38336	279 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	YNL140C	P53910	189 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	CAT8	P39113	1433 aa		4.21	□□□□□ -1.73
CBT1	YKL208W	PUT1	P09368	476 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YER188W	P40103	239 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	PET191	Q02772	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	ARO80	Q04052	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	GRX8	Q05926	109 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	ATG39	Q06159	398 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	SIR2	P06700	562 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YHR125W	P38831	101 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	FMP32	P43557	207 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	JAC1	P53193	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	RSM10	Q03201	203 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	GRE1	Q08969	168 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	SAS5	Q99314	248 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	Q0255	P03881	472 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	CCA1	P21269	546 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YNL184C	P53876	108 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	PEX12	Q04370	399 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	GGA1	Q06336	557 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	TRX3	P25372	127 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	GLE2	P40066	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	GON7	P46984	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	CNB1	P25296	175 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	MED6	P38782	295 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	PLP1	Q04004	230 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YKR032W	P36127	104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	AME1	P38313	324 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBT1	YKL208W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	BET1	P22804	142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	UBC12	P52491	188 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	GAS3	Q03655	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SUE1	Q06524	206 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	PSF1	Q12488	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	VMR1	P38735	1592 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	CDC8	P00572	216 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	REP2	P03872	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SEC17	P32602	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YER121W	P40076	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	NUP49	Q02199	472 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	IES4	Q08561	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	AKR2	Q12013	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SRB8	P25648	1427 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	VMA11	P32842	164 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	CLG1	P35190	452 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	AIM2	P39721	246 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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