RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	MRP51	Q02950	344 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	CAB5	Q03941	241 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SMA2	Q04658	369 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	DCN1	Q12395	269 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	GAL7	P08431	366 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SEC59	P20048	519 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	GPX1	P36014	167 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YEA6	P39953	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	UFD1	P53044	361 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ERV14	P53173	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	STD1	Q02794	444 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ADD37	Q03233	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	TMA23	Q03525	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RTT103	Q05543	409 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SRL1	Q08673	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	TIM18	Q08749	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	OPI3	P05375	206 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	STE18	P18852	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	PPH21	P23594	369 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SCM4	P32564	187 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	UMP1	P38293	148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	AIM24	P47127	394 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YGL114W	P53134	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	COQ10	Q08058	207 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MCT1	Q12283	360 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SET6	Q12529	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MRS3	P10566	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	CTA1	P15202	515 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YCR101C	P25607	182 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	PMU1	P36069	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MRPL28	P36527	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	PAU15	P40585	124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YGL185C	P53100	379 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	NUP53	Q03790	475 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	GMC1	Q04399	608 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SEN15	Q04675	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SRL2	Q12020	392 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RNH203	Q12338	110 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	QCR2	P07257	368 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	POP5	P28005	173 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	AGA2	P32781	87 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MST28	P39552	234 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YEA4	P40004	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	FLX1	P40464	311 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MOB1	P40484	314 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	BRR6	P53062	197 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	PET191	Q02772	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	NCE101	Q02820	53 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RSM10	Q03201	203 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	ARR2	Q06597	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MHR1	Q06630	226 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	BSC6	Q08280	497 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YCT1	Q12235	531 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MRPL44	P19956	98 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MRS4	P23500	304 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	PPA2	P28239	310 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	OM14	P38325	134 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	BNS1	P50084	137 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	MGA1	P53050	456 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	VPS28	Q02767	242 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	THI74	Q04083	370 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	CTR3	Q06686	241 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	UBA3	Q99344	299 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VHS1	YDR247W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	YHR180W	P38868	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	YGL262W	P53054	175 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	RNH201	P53942	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	AVO2	Q04749	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	DAP1	Q12091	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VHS1	YDR247W	MCP1	Q12106	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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