RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C LYS2P07702 1392 aa5.3□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C TOR1P35169 2470 aa5.3□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C FRD1P32614 470 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C GAS5Q08193 484 aa5.3□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C DCD1P06773 312 aa5.29□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C PDI1P17967 522 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C RPN1P38764 993 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C RMT2Q03305 412 aa5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C FLO11P08640 1367 aa5.28□□□□□ -1.56
SUP53tL(CAA)C AFG2P32794 780 aa5.27□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.27□□□□□ -1.57not detected
SUP53tL(CAA)C RTF1P53064 558 aa5.27□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C PHM7Q12252 991 aa5.27□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C RSC30P38781 883 aa5.26□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C SAS4Q04003 481 aa5.26□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C RBA50Q04418 439 aa5.26□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C ARG8P18544 423 aa5.25□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C ASH1P34233 588 aa5.25□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C FKH1P40466 484 aa5.25□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C ULP1Q02724 621 aa5.25□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C SGD1Q06132 899 aa5.25□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C ALE1Q08548 619 aa5.25□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C CBP1P07252 654 aa5.24□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C DSD1P53095 428 aa5.24□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C PAH1P32567 862 aa5.23□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C FAB1P34756 2278 aa5.22□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C UBR2Q07963 1872 aa5.22□□□□□ -1.57
SUP53tL(CAA)C APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C RTG3P38165 486 aa5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C MDG1P53885 366 aa5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C JIP4Q03361 876 aa5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C TAP42Q04372 366 aa5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C FLO1P32768 1537 aa5.2□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C GRX4P32642 244 aa5.2□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C GSM1P42950 618 aa5.19□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.18□□□□□ -1.58not detected
SUP53tL(CAA)C MTC3P53077 123 aa5.18□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C CTF4Q01454 927 aa5.18□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C PEX29Q03370 554 aa5.18□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C YPR204WQ08995 1032 aa5.18□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C PSF2P40359 213 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C VPS62P53285 467 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C CRF1Q04930 467 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C SSP2Q08646 371 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C HAT1Q12341 374 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C TEL1P38110 2787 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C ECM29P38737 1868 aa5.17□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C HIP1P06775 603 aa5.16□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C KRE2P27809 442 aa5.16□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C FIR1P40020 876 aa5.16□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C EAR1Q03212 550 aa5.16□□□□□ -1.58
SUP53tL(CAA)C KCC4P25389 1037 aa5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C YHR131CP38835 850 aa5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C SPL2P38839 148 aa5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C SPR3P41901 512 aa5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C TOS4Q06266 489 aa5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C IXR1P33417 597 aa5.14□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C LDH1P38139 375 aa5.14□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C RPT4P53549 437 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C AOS1Q06624 347 aa5.14□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C ECM30Q06673 1274 aa5.13□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C AHC1Q12433 566 aa5.13□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.12□□□□□ -1.59not detected
SUP53tL(CAA)C NTH2P35172 780 aa5.12□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C ICP55P40051 511 aa5.12□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C NIT1P40447 199 aa5.12□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C ZDS2P54786 942 aa5.12□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C FCP1Q03254 732 aa5.12□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C PPM2Q08282 695 aa5.12□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C ERG7P38604 731 aa5.1□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C YJL171CP46992 396 aa5.1□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C PRY3P47033 881 aa5.1□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C VPS64Q03944 604 aa5.1□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C KAR2P16474 682 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C AFG3P39925 761 aa5.09□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C YPL034WQ03083 165 aa5.09□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C GIN4Q12263 1142 aa5.09□□□□□ -1.59
SUP53tL(CAA)C ARG82P07250 355 aa5.08□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C GAL2P13181 574 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.6 ms