RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NUP133P36161 1157 aa5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W RPN11P43588 306 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W SSP2Q08646 371 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W DCD1P06773 312 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NPR2P39923 615 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NHA1Q99271 985 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W ATG36P46983 293 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W VPS64Q03944 604 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W LAM6Q08001 693 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W PHM7Q12252 991 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W YMR074CQ04773 145 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W LPD1P09624 499 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W ASF1P32447 279 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W YLR271WQ06152 274 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W UBP12P39538 1254 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W TPO2P53283 614 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W YIR014WP40570 242 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NKP2Q06162 153 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W SSA1P10591 642 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W SSA2P10592 639 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W GLN1P32288 370 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W PRP40P33203 583 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W HGH1P48362 394 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W TLG1Q03322 224 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W MSB4Q12317 492 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W OPY1P38271 328 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W TEA1P47988 759 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W TCB2P48231 1178 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W CDC16P09798 840 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W BRN1P38170 754 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W RFC1P38630 861 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W HXT10P43581 546 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W FCP1Q03254 732 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W NYV1Q12255 253 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W YGL082WP53155 381 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W YJL181WP46987 611 aa5.59□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W RAD50P12753 1312 aa5.59□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W ITC1P53125 1264 aa5.58□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W SER1P33330 395 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W PKH1Q03407 766 aa5.57□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W MTC5Q03897 1148 aa5.57□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W RTS3P53289 263 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W ISW1P38144 1129 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W BDP1P46678 594 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W CTH1P47976 325 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W GCR2Q01722 534 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W SAC3P46674 1301 aa5.55□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W NOT3P06102 836 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W IME2P32581 645 aa5.55□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W UBP1P25037 809 aa5.55□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W SLA1P32790 1244 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W DLD1P32891 587 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W UBP16Q02863 499 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W BUG1Q12191 341 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W NCB2Q92317 146 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W OSW7P43611 510 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W YGL242CP53066 181 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W BDF1P35817 686 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data5.53□□□□□ -1.52not detected
YMR196WYMR196W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W HAT1Q12341 374 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W HXT13P39924 564 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W HXT17P53631 564 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W GYP5Q12344 894 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W PDR18P53756 1333 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR196WYMR196W AI2P03876 854 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W PCT1P13259 424 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W MRPS35P53292 345 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W YML020WQ03722 664 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W MLC1P53141 149 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W TOS1P38288 455 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RMD1Q03441 430 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W PMD1P32634 1753 aa5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W ADR1P07248 1323 aa5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RNA1P11745 407 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SEC18P18759 758 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RPG1P38249 964 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W CTI6Q08923 506 aa5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W SUP35P05453 685 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W PIB2P53191 635 aa5.51□□□□□ -1.53
YMR196WYMR196W GRX3Q03835 250 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.1 ms