RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W HXT10P43581 546 aa3.85□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W ATF2P53296 535 aa3.85□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W HST2P53686 357 aa3.85□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W FPK1P53739 893 aa3.84□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W ULS1Q08562 1619 aa3.84□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W MYO4P32492 1471 aa3.82□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W PDC1P06169 563 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W STU1P38198 1513 aa3.82□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W SLY41P22215 453 aa3.82□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W MDJ1P35191 511 aa3.81□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W PHM7Q12252 991 aa3.81□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W KIP2P28743 706 aa3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W RPN1P38764 993 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W MET10P39692 1035 aa3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data3.8□□□□□ -1.8not detected
SSQ1YLR369W TBF1Q02457 562 aa3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W TRM3Q07527 1436 aa3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W PDR12Q02785 1511 aa3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W GLN1P32288 370 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W DNF3Q12674 1656 aa3.79□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W MRT4P33201 236 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W MMP1Q12372 583 aa3.79□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W DPH6Q12429 685 aa3.79□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W PDR10P51533 1564 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W IXR1P33417 597 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W PUS6P53294 404 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W LSC2P53312 427 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W UBP2Q01476 1272 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W IQG1Q12280 1495 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W RPA14P50106 137 aa3.78□□□□□ -1.8
SSQ1YLR369W GDB1Q06625 1536 aa3.77□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W TRM1P15565 570 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W SCJ1P25303 377 aa3.77□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W KIN1P13185 1064 aa3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W KTR1P27810 393 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W RTT106P40161 455 aa3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W ROG3P43602 733 aa3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W YPR097WQ06839 1073 aa3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W ALR1Q08269 859 aa3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W TY1A-MR1Q04215 440 aa3.76□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W ARG82P07250 355 aa3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W SSA2P10592 639 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W ESS1P22696 170 aa3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W RSC30P38781 883 aa3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W AAD14P42884 376 aa3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W CSN12P47130 423 aa3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W YDL206WQ12424 762 aa3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W TCB1Q12466 1186 aa3.74□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W CCP1P00431 361 aa3.74□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W DLD1P32891 587 aa3.74□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W YJR098CP47139 656 aa3.74□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W NSG2P53898 299 aa3.74□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W YJU3P28321 313 aa3.73□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W OSH7P38755 437 aa3.73□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W LYS5P50113 272 aa3.73□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W YTA7P40340 1379 aa3.72□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W BUD3P25558 1636 aa3.72□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W USO1P25386 1790 aa3.72□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SSQ1YLR369W THI72Q08579 599 aa3.71□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W MLP2P40457 1679 aa3.71□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W JJJ3P47138 172 aa3.71□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W HPC2Q01448 625 aa3.71□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W RAD59Q12223 238 aa3.71□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W STH1P32597 1359 aa3.7□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W VAC17P25591 423 aa3.7□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W ARG8P18544 423 aa3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W YBL086CP38177 466 aa3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W TY3B-GQ99315 1547 aa3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W YAP3P38749 330 aa3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W YFL066CP43538 392 aa3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W MAK10Q02197 733 aa3.69□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W YSP2Q06681 1438 aa3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W NAF1P53919 492 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W AI1P03875 834 aa3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W CSE4P36012 229 aa3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W LEO1P38439 464 aa3.67□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W FIG4P42837 879 aa3.65□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
SSQ1YLR369W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W YPR084WQ06821 456 aa3.65□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W BNR1P40450 1375 aa3.65□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W TEC1P18412 486 aa3.64□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W BRL1P38770 471 aa3.64□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W EMW1P42842 904 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W APP1P53933 587 aa3.64□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.63□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W THI12P42883 340 aa3.62□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W THI5P43534 340 aa3.62□□□□□ -1.83
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