RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W PEA2P40091 420 aa12.01□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W VPS4P52917 437 aa12.01□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W SET4P42948 560 aa11.99□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W EMP47P43555 445 aa11.99□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W MAC1P35192 417 aa11.98□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W STV1P37296 890 aa11.98□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W PIB1Q06651 286 aa11.97□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W YPR204WQ08995 1032 aa11.97□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W YGR117CP53270 476 aa11.96□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W SRF1Q12516 437 aa11.96□□□□□ -0.49
YLR349WYLR349W HPR1P17629 752 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W UGA3P26370 528 aa11.95□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W ISW2Q08773 1120 aa11.95□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W HAT1Q12341 374 aa11.95□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W VPS64Q03944 604 aa11.94□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W ZDS2P54786 942 aa11.93□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W GAS5Q08193 484 aa11.93□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W AFG2P32794 780 aa11.92□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W PAM1P37304 830 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W AVT3P36062 692 aa11.91□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W NSE3Q05541 303 aa11.91□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W HVG1P0CE11 249 aa11.9□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W PNT1P38969 423 aa11.9□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
YLR349WYLR349W CSR2Q12734 1121 aa11.89□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W BSD2P38356 321 aa11.87□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W NCS6P53088 359 aa11.87□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data11.86□□□□□ -0.51not detected
YLR349WYLR349W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W FLO11P08640 1367 aa11.85□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W YNL050CP53952 270 aa11.85□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W FCP1Q03254 732 aa11.84□□□□□ -0.51
YLR349WYLR349W LYS2P07702 1392 aa11.83□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W GSC2P40989 1895 aa11.83□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W TRP5P00931 707 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W GSM1P42950 618 aa11.83□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W PKH1Q03407 766 aa11.83□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W CRF1Q04930 467 aa11.83□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W KRE2P27809 442 aa11.82□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data11.82□□□□□ -0.52not detected
YLR349WYLR349W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W CST9Q06032 482 aa11.82□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W COQ4O13525 335 aa11.81□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W YBR287WP38355 427 aa11.81□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W CBP1P07252 654 aa11.8□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W MOT2P34909 587 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W RPT4P53549 437 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W YLR271WQ06152 274 aa11.79□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W DPH6Q12429 685 aa11.79□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W POL5P39985 1022 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
YLR349WYLR349W APE3P37302 537 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W SPL2P38839 148 aa11.77□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W ICP55P40051 511 aa11.77□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W AAD16Q02895 342 aa11.76□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W MAL31P38156 614 aa11.75□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W UBX2Q04228 584 aa11.74□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W RSC30P38781 883 aa11.73□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W TOS4Q06266 489 aa11.73□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W SWI1P09547 1314 aa11.72□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W PRD1P25375 712 aa11.72□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W UTP7P40055 554 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W RBA50Q04418 439 aa11.71□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W THI3Q07471 609 aa11.71□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W YOL057WQ08225 711 aa11.71□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W YPR117WQ06116 2489 aa11.71□□□□□ -0.53
YLR349WYLR349W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W MGM1P32266 881 aa11.7□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W MAM1P40065 302 aa11.7□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W NGR1P32831 672 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W MTC3P53077 123 aa11.68□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W DNM1P54861 757 aa11.67□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W ASH1P34233 588 aa11.66□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W NUP133P36161 1157 aa11.66□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W IRC4Q03036 179 aa11.66□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W JIP4Q03361 876 aa11.66□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W SGD1Q06132 899 aa11.66□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W TAO3P40468 2376 aa11.65□□□□□ -0.54
YLR349WYLR349W ARG82P07250 355 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W LCB1P25045 558 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W NIT1P40447 199 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W CST6P40535 587 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W ITC1P53125 1264 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W PEX29Q03370 554 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W THI22Q06490 572 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W RTT109Q07794 436 aa11.64□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.7 ms