RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W DLD1P32891 587 aa5.87□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W SUM1P46676 1062 aa5.87□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W CYT1P07143 309 aa5.86□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W YJR098CP47139 656 aa5.86□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W VAN1P23642 535 aa5.86□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W UBP1P25037 809 aa5.85□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W MSN5P52918 1224 aa5.85□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W UBP2Q01476 1272 aa5.85□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W OPT2Q06593 877 aa5.85□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W MET22P32179 357 aa5.84□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W VTC4P47075 721 aa5.84□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W TRS33Q99394 268 aa5.84□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W GEF1P37020 779 aa5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W SSN3P39073 555 aa5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W ALA1P40825 983 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W YDR444WQ04093 687 aa5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W DAL1P32375 460 aa5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W YPQ2Q06328 317 aa5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W TCB1Q12466 1186 aa5.83□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W MCM1P11746 286 aa5.82□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W GLY1P37303 387 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W CWH41P53008 833 aa5.82□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W SCW11P53189 542 aa5.81□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W AHP1P38013 176 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W PUN1Q06991 263 aa5.79□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W SRS2P12954 1174 aa5.79□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W JJJ2P46997 583 aa5.79□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W TY1A-BLQ12266 440 aa5.79□□□□□ -1.48
HCA4YJL033W SLA1P32790 1244 aa5.77□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W OSH7P38755 437 aa5.77□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W IRE1P32361 1115 aa5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W SUV3P32580 737 aa5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W CDC3P32457 520 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W SCD5P34758 872 aa5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W PNP1Q05788 311 aa5.76□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W UBP15P50101 1230 aa5.75□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W TY1A-DR3Q12441 440 aa5.75□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W HXT5P38695 592 aa5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W Q0182Q9ZZW1 134 aa5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W YTA6P40328 754 aa5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W SSN2P38931 1420 aa5.74□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.73□□□□□ -1.49not detected
HCA4YJL033W ACO2P39533 789 aa5.73□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W YNL165WP53891 406 aa5.73□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W CAB1Q04430 367 aa5.73□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W RPS31P05759 152 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W RRN6P32786 894 aa5.73□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W RGA1P39083 1007 aa5.73□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W MLF3P32047 452 aa5.72□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W YBR197CP38306 217 aa5.72□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W PDC6P26263 563 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
HCA4YJL033W FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W PSH1Q12161 406 aa5.71□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W ROG3P43602 733 aa5.7□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W KAR5Q04746 504 aa5.7□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W ISC10P32645 267 aa5.7□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W CAF120P53836 1060 aa5.7□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W TY1A-MR1Q04215 440 aa5.7□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W MRPL33P20084 86 aa5.69□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W YIR007WP40566 764 aa5.69□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W LEU1P07264 779 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W BOL3P39724 118 aa5.67□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W HAT1Q12341 374 aa5.67□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W LSO1Q3E827 93 aa5.67□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W KAP122P32767 1081 aa5.66□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W MTO1P53070 669 aa5.66□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W YDL176WQ12027 708 aa5.66□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W VMA3P25515 160 aa5.66□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W ALD2P47771 506 aa5.66□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W DIT1P21623 536 aa5.65□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W DYS1P38791 387 aa5.65□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W CUZ1P53899 274 aa5.65□□□□□ -1.5
HCA4YJL033W MRPL16P38064 232 aa5.65□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W QDR2P40474 542 aa5.65□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W CCP1P00431 361 aa5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W RGP1P16664 663 aa5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W LDH1P38139 375 aa5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W ATG1P53104 897 aa5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W APC11Q12157 165 aa5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W STB3Q12427 513 aa5.64□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W RPC31P17890 251 aa5.63□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HCA4YJL033W GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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