RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	VID30	P53076	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	NDL1	Q06568	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	SRS2	P12954	1174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	PSO2	P30620	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	PBY1	P38254	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	ARP5	P53946	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SKG6	YHR149C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	ORM2	Q06144	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	PDR11	P40550	1411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	MSH1	P25846	959 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	HOS4	P40480	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	PEX19	Q07418	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	NFI1	Q12216	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	RAV1	P47104	1357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	CDC11	P32458	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	RPN12	P32496	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	SLP1	Q12232	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG6	YHR149C	LEM3	P42838	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MCM1	P11746	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MRC1	P25588	1096 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	DSF2	P38213	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	IAH1	P41734	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	DNM1	P54861	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TLG2	Q08144	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	PHO87	P25360	923 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SEC9	P40357	651 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MRX12	P47084	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	NUP145	P49687	1317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	KRE5	P22023	1365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	CIR1	P42940	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RAD50	P12753	1312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	BDH2	P39713	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	AIM20	P40451	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RRT14	P40470	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RSM25	P40496	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TIM50	Q02776	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	GGA1	Q06336	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	NUF2	P33895	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	ARR1	Q06596	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SLD2	P34252	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SIT1	P39980	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	POL32	P47110	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	GLE1	Q12315	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SKG6	YHR149C	YGL081W	P53156	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RIA1	P53893	1110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SPO19	Q03029	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MST1	P07236	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MNR2	P35724	969 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SKG6	YHR149C	HST1	P53685	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	UBX2	Q04228	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	PET123	P17558	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MRPS28	P21771	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	BCH2	P36122	765 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MRPL10	P36520	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	EXO84	P38261	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	MPH1	P40562	993 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	JJJ1	P53863	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	ARO80	Q04052	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	KEX2	P13134	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	DAL5	P15365	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	APL6	P46682	809 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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