RNA–Protein interactions for RNA: YHR083W

SAM35, Transcript of Component of the sorting and assembly machinery (SAM) complex, yeast

Gene SAM35, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAM35	YHR083W	PDR18	P53756	1333 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	MLC1	P53141	149 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	YPR204W	Q08995	1032 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	PSH1	Q12161	406 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	UBP1	P25037	809 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	BRN1	P38170	754 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	TEA1	P47988	759 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	ITC1	P53125	1264 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	SAC3	P46674	1301 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	SRS2	P12954	1174 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	CLC1	P17891	233 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	RLF2	Q12495	606 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SAM35	YHR083W	ARG8	P18544	423 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	YGL242C	P53066	181 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	YGL082W	P53155	381 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	COG8	Q04632	607 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	BUG1	Q12191	341 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	YMR074C	Q04773	145 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	HAT1	Q12341	374 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	GYP5	Q12344	894 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	ROX1	P25042	368 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	RIM20	Q12033	661 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	NYV1	Q12255	253 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SAM35	YHR083W	SPO22	P40511	975 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	PIF1	P07271	859 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	HXT13	P39924	564 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	MSP1	P28737	362 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	BDF1	P35817	686 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	SIS2	P36024	562 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	MRPS35	P53292	345 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	FCP1	Q03254	732 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	DCD1	P06773	312 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	HXT17	P53631	564 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	RMD1	Q03441	430 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SAM35	YHR083W	OPI1	P21957	404 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	PBY1	P38254	753 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	RRI2	Q12348	645 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	ADR1	P07248	1323 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	BIK1	P11709	440 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	TTI1	P36097	1038 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	DJP1	P40564	432 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	HST1	P53685	503 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	BDH2	P39713	417 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	NPR2	P39923	615 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	PEX14	P53112	341 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	POM152	P39685	1337 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	GEF1	P37020	779 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	ALD3	P54114	506 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	HAP5	Q02516	242 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	NPL4	P33755	580 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	GTT3	P39996	337 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	SRC1	Q03707	834 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	VPS20	Q04272	221 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	PSK2	Q08217	1101 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	RSM25	P40496	264 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	HXT10	P43581	546 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	ALD2	P47771	506 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	DPH6	Q12429	685 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SAM35	YHR083W	KEX1	P09620	729 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	EPS1	P40557	701 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	UBP16	Q02863	499 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	AIM44	Q99299	758 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	SLA1	P32790	1244 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61

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