RNA–Protein interactions for RNA: YHR003C

TCD1, Transcript of tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase, yeast

Gene TCD1, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TCD1	YHR003C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	TSC13	Q99190	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	SWI5	P08153	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	SSN3	P39073	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	KTR7	P40504	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	CAF120	P53836	1060 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	RLF2	Q12495	606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	HAP4	P14064	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	PHO87	P25360	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	NTH2	P35172	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	GAL2	P13181	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	TGL4	P36165	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCD1	YHR003C	CPS1	P27614	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	YIR007W	P40566	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	GAS4	Q08271	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	SLA1	P32790	1244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	ROG3	P43602	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	CYT1	P07143	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	MCM1	P11746	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	JJJ2	P46997	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	UBP15	P50101	1230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	UBP1	P25037	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	IRE1	P32361	1115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	ROM1	P53046	1155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	ECM23	Q02710	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	PUP1	P25043	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	CCP1	P00431	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	VAN1	P23642	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	YGR035C	P53222	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCD1	YHR003C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	UBX7	P38349	436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	LYS5	P50113	272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	CUZ1	P53899	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	DIT1	P21623	536 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	YTA6	P40328	754 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	CWH41	P53008	833 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	HPF1	Q05164	967 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	TRS33	Q99394	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	PSH1	Q12161	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	DPH6	Q12429	685 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	SCD5	P34758	872 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	CEM1	P39525	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	YNL165W	P53891	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	TRK2	P28584	889 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	MLF3	P32047	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	MRPL16	P38064	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	HXT5	P38695	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	YML083C	Q04526	418 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TCD1	YHR003C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SUV3	P32580	737 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	JJJ3	P47138	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	RGP1	P16664	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	ALD2	P47771	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	PUN1	Q06991	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	STB3	Q12427	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SRS2	P12954	1174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	FPS1	P23900	669 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SPR3	P41901	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	KAP122	P32767	1081 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	MTO1	P53070	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	CAB1	Q04430	367 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	YBR197C	P38306	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	MRPL33	P20084	86 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SKP1	P52286	194 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	KOG1	P38873	1557 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCD1	YHR003C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	QDR2	P40474	542 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	PNP1	Q05788	311 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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