RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C ALA1P40825 983 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C MCA1Q08601 432 aa5.43□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C AIM7Q12156 149 aa5.43□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C UTR2P32623 467 aa5.42□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C GLC3P32775 704 aa5.42□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C TY1A-DR3Q12441 440 aa5.42□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C YPL034WQ03083 165 aa5.4□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C SSA2P10592 639 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C IRE1P32361 1115 aa5.39□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C OMA1P36163 345 aa5.39□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C MRPL16P38064 232 aa5.38□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C SUM1P46676 1062 aa5.38□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C JJJ2P46997 583 aa5.38□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C DMA1P38823 416 aa5.37□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C ISR1Q06098 443 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C INP52P50942 1183 aa5.35□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C PRY1P47032 299 aa5.34□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C STB3Q12427 513 aa5.34□□□□□ -1.55
GCN4YEL009C SPR3P41901 512 aa5.32□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.31□□□□□ -1.56not detected
GCN4YEL009C ATG3P40344 310 aa5.31□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C NHA1Q99271 985 aa5.31□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C PDC6P26263 563 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C CSE4P36012 229 aa5.3□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C APL6P46682 809 aa5.29□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C EMP47P43555 445 aa5.28□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C PSH1Q12161 406 aa5.28□□□□□ -1.56
GCN4YEL009C SLX8P40072 274 aa5.27□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C AVT1P47082 602 aa5.27□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C YTA6P40328 754 aa5.25□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C BUD9P53226 547 aa5.25□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C HEH2Q03281 663 aa5.24□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C ALG14P38242 237 aa5.23□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C TFB3Q03290 321 aa5.23□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C MCM16Q12262 181 aa5.23□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C AI3P03877 415 aa5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C LEU1P07264 779 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C YPP1P46951 817 aa5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C HPC2Q01448 625 aa5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C HDA3Q06623 655 aa5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C AOS1Q06624 347 aa5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C MED7Q08278 222 aa5.22□□□□□ -1.57
GCN4YEL009C SAC7P17121 654 aa5.21□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C COQ2P32378 372 aa5.2□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C MSC7P38694 644 aa5.2□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C HAL5P38970 855 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C RGP1P16664 663 aa5.19□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C ISF1P32488 338 aa5.19□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C RPS31P05759 152 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C KAE1P36132 386 aa5.18□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C SFA1P32771 386 aa5.17□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C SOH1P38633 127 aa5.17□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C LIP5P32875 414 aa5.16□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C YPQ2Q06328 317 aa5.16□□□□□ -1.58
GCN4YEL009C ELM1P32801 640 aa5.15□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C MCM1P11746 286 aa5.14□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C YFL034WP43564 1073 aa5.14□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C SWI5P08153 709 aa5.13□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C NCL1P38205 684 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C ALD2P47771 506 aa5.13□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C YBL036CP38197 257 aa5.12□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C RRM3P38766 723 aa5.12□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C GIS4Q04233 774 aa5.12□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data5.12□□□□□ -1.59not detected
GCN4YEL009C NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.11□□□□□ -1.59 RIP-Chip
GCN4YEL009C RSC6P25632 483 aa5.1□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C TOS1P38288 455 aa5.1□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C SLP1Q12232 587 aa5.1□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C CHS2P14180 963 aa5.09□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C AIM9P40053 627 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C PRK1P40494 810 aa5.09□□□□□ -1.59
GCN4YEL009C TRP3P00937 484 aa5.08□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C YKR073CP36153 106 aa5.08□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C UBP5P39944 805 aa5.07□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C BRE4Q07660 1125 aa5.07□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C YLR122CQ12312 125 aa5.07□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C MLF3P32047 452 aa5.06□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C SAF1P38352 637 aa5.06□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C SKP1P52286 194 aa5.06□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C KIN1P13185 1064 aa5.05□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C GAS5Q08193 484 aa5.05□□□□□ -1.6
GCN4YEL009C Q0182Q9ZZW1 134 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 194.3 ms