RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636904.1

U6.97-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.97-201ENST00000636904 POU5F2Q8N7G0 328 aa0.49□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa0.49□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 STAG3Q9UJ98 1225 aa0.49□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa0.49□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 ENAMQ9NRM1 1142 aa0.48□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 DBX1A6NMT0 343 aa0.47□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 PODNQ7Z5L7 613 aa0.47□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 ANKK1Q8NFD2 765 aa0.47□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 VWCEQ96DN2 955 aa0.47□□□□□ -2.33
U6.97-201ENST00000636904 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 ELNP15502 786 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 CRELD1Q96HD1 420 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 NBPF3Q9H094 633 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 ACSS3Q9H6R3 686 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 BOLA1Q9Y3E2 137 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa0.46□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 VEGFBP49765 207 aa0.45□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 PSEN2P49810 448 aa0.45□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 ZNF697Q5TEC3 545 aa0.45□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 BRIP1Q9BX63 1249 aa0.45□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 LHX6Q9UPM6 363 aa0.45□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 KRBA1A5PL33 1030 aa0.44□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 SOWAHBA6NEL2 793 aa0.44□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 TNFRSF10AO00220 468 aa0.44□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 MAP3K10Q02779 954 aa0.44□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 IL21Q9HBE4 155 aa0.44□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 TJAP1Q5JTD0 557 aa0.43□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 OGFOD2Q6N063 350 aa0.43□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 TOR4AQ9NXH8 423 aa0.43□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 LRCH2Q5VUJ6 765 aa0.42□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP0.41□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa0.41□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa0.41□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa0.4□□□□□ -2.34
U6.97-201ENST00000636904 NUDT7P0C024 238 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 KRT10P13645 584 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 CD97P48960 835 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 KRT76Q01546 638 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 NKAPLQ5M9Q1 402 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 BHLHA9Q7RTU4 235 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 LAPTM4BQ86VI4 370 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 IFNL1Q8IU54 200 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 CYP4X1Q8N118 509 aa0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP0.4□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 DYRK3O43781 588 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SMPD1P17405 629 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 GOLGA2Q08379 1002 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 DOC2BQ14184 412 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 ERFEQ4G0M1 354 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 PRSS36Q5K4E3 855 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 TTLL10Q6ZVT0 673 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 KCNK12Q9HB15 430 aa0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SIAH1Q8IUQ4 282 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 MICALL1Q8N3F8 863 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 MPNDQ8N594 471 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 ANKLE1Q8NAG6 615 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 WHAMMQ8TF30 809 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SLC4A9Q96Q91 983 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 MENTQ9BUN1 341 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 PKD2L1Q9P0L9 805 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SALL3Q9BXA9 1300 aa0.38□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SLC34A2O95436 690 aa0.37□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 ITGB6P18564 788 aa0.37□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 BCAMP50895 628 aa0.37□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 LRRC4BQ9NT99 713 aa0.37□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 PIK3R2O00459 728 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 GATA4P43694 442 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 GGNQ86UU5 652 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 CD163Q86VB7 1156 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 KCNK17Q96T54 332 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 RNF112Q9ULX5 631 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa0.36□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 CDCP2Q5VXM1 449 aa0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 LIAT1Q6ZQX7 453 aa0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 ASIC4Q96FT7 647 aa0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 MTRQ99707 1265 aa0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 ZBED2Q9BTP6 218 aa0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
U6.97-201ENST00000636904 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms