RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTIF-207ENST00000589585 SOCS7O14512 581 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-207ENST00000589585 FOXD1Q16676 465 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-207ENST00000589585 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-207ENST00000589585 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-207ENST00000589585 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.39■□□□□ 0.86
CTIF-207ENST00000589585 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.39■□□□□ 0.85
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CTIF-207ENST00000589585 ALKQ9UM73 1620 aa20.38■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 PIP4K2BP78356 416 aa20.37■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 ZFYVE9O95405 1425 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 TOM1O60784 492 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-207ENST00000589585 TRPM2O94759 1503 aa20.35■□□□□ 0.85
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CTIF-207ENST00000589585 CLTCL1P53675 1640 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-207ENST00000589585 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-207ENST00000589585 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-207ENST00000589585 KCNA6P17658 529 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-207ENST00000589585 HRCP23327 699 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-207ENST00000589585 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.27■□□□□ 0.83
CTIF-207ENST00000589585 TBX22Q9Y458 520 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTIF-207ENST00000589585 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTIF-207ENST00000589585 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-207ENST00000589585 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CTIF-207ENST00000589585 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.21■□□□□ 0.83
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CTIF-207ENST00000589585 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.19■□□□□ 0.82
CTIF-207ENST00000589585 TMEM94Q12767 1356 aa20.17■□□□□ 0.82
CTIF-207ENST00000589585 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-207ENST00000589585 DIP2AQ14689 1571 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-207ENST00000589585 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 PIK3R4Q99570 1358 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 NWD1Q149M9 1564 aa20.12■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 METP08581 1390 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 C14orf37Q86TY3 774 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-207ENST00000589585 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.1■□□□□ 0.81
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CTIF-207ENST00000589585 MSH6P52701 1360 aa20.07■□□□□ 0.8
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CTIF-207ENST00000589585 ATF3P18847 181 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 DCAF11Q8TEB1 546 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 SLAIN2Q9P270 581 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 STK26Q9P289 416 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.98■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 PIK3C2GO75747 1445 aa19.98■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 IFT172Q9UG01 1749 aa19.97■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 CADPS2Q86UW7 1296 aa19.97■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 PHLPP1O60346 1717 aa19.96■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.95■□□□□ 0.79
CTIF-207ENST00000589585 MYOM2P54296 1465 aa19.95■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.95■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 STAC3Q96MF2 364 aa19.92■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 PTCH1Q13635 1447 aa19.92■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.92■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 NEUROD1Q13562 356 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-207ENST00000589585 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.89■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 ABCC11Q96J66 1382 aa19.88■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.87■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 DCCP43146 1447 aa19.87■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.86■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 TECPR2O15040 1411 aa19.85■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 BRINP3Q76B58 766 aa19.83■□□□□ 0.77
CTIF-207ENST00000589585 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.83■□□□□ 0.76
CTIF-207ENST00000589585 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.82■□□□□ 0.76
CTIF-207ENST00000589585 POTEAQ6S8J7 498 aa19.82■□□□□ 0.76
CTIF-207ENST00000589585 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.82■□□□□ 0.76
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