RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 IQGAP1P46940 1657 aa20.48■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.46■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 RGL3Q3MIN7 710 aa20.44■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.42■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 NEUROD1Q13562 356 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 EID1Q9Y6B2 187 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 LTKP29376 864 aa20.4■□□□□ 0.86
GGA3-216ENST00000583282 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.38■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 MED14O60244 1454 aa20.38■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 MYOM2P54296 1465 aa20.36■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.35■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.35■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 BCANQ96GW7 911 aa20.35■□□□□ 0.85
GGA3-216ENST00000583282 DIP2AQ14689 1571 aa20.33■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.32■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 TONSLQ96HA7 1378 aa20.32■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.29■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.29■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 LAMC1P11047 1609 aa20.29■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.29■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.28■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 PIK3C2GO75747 1445 aa20.28■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.28■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.28■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 ALKQ9UM73 1620 aa20.27■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.27■□□□□ 0.84
GGA3-216ENST00000583282 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.26■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.26■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.25■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.25■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 NWD1Q149M9 1564 aa20.24■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.22■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GGA3-216ENST00000583282 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.2■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 METP08581 1390 aa20.19■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.19■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 PTPRUQ92729 1446 aa20.17■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.16■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.16■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.15■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 TBX22Q9Y458 520 aa20.15■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 ADGRB1O14514 1584 aa20.15■□□□□ 0.82
GGA3-216ENST00000583282 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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GGA3-216ENST00000583282 PIK3R4Q99570 1358 aa20.12■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 STAC3Q96MF2 364 aa20.12■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.11■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.1■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.09■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 KCNA6P17658 529 aa20.08■□□□□ 0.81
GGA3-216ENST00000583282 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.07■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 STK26Q9P289 416 aa20.07■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.07■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 PTCH1Q13635 1447 aa20.07■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.06■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.04■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.04■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 TECPR2O15040 1411 aa20.03■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 DLC1Q96QB1 1528 aa20.02■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.02■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 TMEM94Q12767 1356 aa20.02■□□□□ 0.8
GGA3-216ENST00000583282 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 TRAK1Q9UPV9 953 aa20■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.99■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 ABCC11Q96J66 1382 aa19.98■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.97■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 C14orf37Q86TY3 774 aa19.97■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
GGA3-216ENST00000583282 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.95■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.95■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.95■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 CERKQ8TCT0 537 aa19.95■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.95■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.94■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 PRAM1Q96QH2 718 aa19.94■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 MSH6P52701 1360 aa19.93■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 ADGRB2O60241 1585 aa19.92■□□□□ 0.78
GGA3-216ENST00000583282 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.92■□□□□ 0.78
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