RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, human

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAP1-215	ENST00000576106	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		34.12	■■■■□ 3.05
TRAP1-215	ENST00000576106	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		34.11	■■■■□ 3.05
TRAP1-215	ENST00000576106	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	34.11	■■■■□ 3.05
TRAP1-215	ENST00000576106	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		34.06	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	TOM1	O60784	492 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	KCNA6	P17658	529 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	TRPM2	O94759	1503 aa		34.04	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	34.04	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		34.04	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	34.03	■■■■□ 3.04
TRAP1-215	ENST00000576106	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		34	■■■■□ 3.03
TRAP1-215	ENST00000576106	TBX22	Q9Y458	520 aa		34	■■■■□ 3.03
TRAP1-215	ENST00000576106	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.99	■■■■□ 3.03
TRAP1-215	ENST00000576106	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.96	■■■■□ 3.03
TRAP1-215	ENST00000576106	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.94	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	FOXD1	Q16676	465 aa		33.94	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.91	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.9	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.9	■■■■□ 3.02
TRAP1-215	ENST00000576106	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.88	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.85	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TRAP1-215	ENST00000576106	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
TRAP1-215	ENST00000576106	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.79	■■■■□ 3
TRAP1-215	ENST00000576106	HRC	P23327	699 aa		33.79	■■■■□ 3
TRAP1-215	ENST00000576106	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
TRAP1-215	ENST00000576106	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.77	■■■■□ 3
TRAP1-215	ENST00000576106	KIF1B	O60333	1816 aa		33.77	■■■■□ 3
TRAP1-215	ENST00000576106	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.75	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.75	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	HSPA1L	P34931	641 aa		33.73	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	MSH6	P52701	1360 aa		33.72	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.7	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.7	■■■□□ 2.99
TRAP1-215	ENST00000576106	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TRAP1-215	ENST00000576106	MET	P08581	1390 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TRAP1-215	ENST00000576106	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TRAP1-215	ENST00000576106	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TRAP1-215	ENST00000576106	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TRAP1-215	ENST00000576106	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
TRAP1-215	ENST00000576106	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TRAP1-215	ENST00000576106	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TRAP1-215	ENST00000576106	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TRAP1-215	ENST00000576106	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TRAP1-215	ENST00000576106	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TRAP1-215	ENST00000576106	ATF3	P18847	181 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TRAP1-215	ENST00000576106	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TRAP1-215	ENST00000576106	PPL	O60437	1756 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TRAP1-215	ENST00000576106	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
TRAP1-215	ENST00000576106	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TRAP1-215	ENST00000576106	DCC	P43146	1447 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TRAP1-215	ENST00000576106	MYOM2	P54296	1465 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	STK26	Q9P289	416 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TRAP1-215	ENST00000576106	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	TECPR2	O15040	1411 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	MST1R	Q04912	1400 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TRAP1-215	ENST00000576106	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
TRAP1-215	ENST00000576106	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	LAMC1	P11047	1609 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TRAP1-215	ENST00000576106	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms