RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU2-210ENST00000567949 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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CTU2-210ENST00000567949 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU2-210ENST00000567949 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CTU2-210ENST00000567949 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.26■■■□□ 2.11
CTU2-210ENST00000567949 PPLO60437 1756 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTU2-210ENST00000567949 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU2-210ENST00000567949 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.2■■■□□ 2.11
CTU2-210ENST00000567949 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU2-210ENST00000567949 TMF1P82094 1093 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU2-210ENST00000567949 IDI1Q13907 227 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTU2-210ENST00000567949 MLECQ14165 292 aa28.08■■■□□ 2.09
CTU2-210ENST00000567949 ZFYVE9O95405 1425 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU2-210ENST00000567949 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.06■■■□□ 2.08
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CTU2-210ENST00000567949 MRS2Q9HD23 443 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU2-210ENST00000567949 SLC24A1O60721 1099 aa28.04■■■□□ 2.08
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CTU2-210ENST00000567949 ZMYM3Q14202 1370 aa27.96■■■□□ 2.07
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CTU2-210ENST00000567949 NLRP13Q86W25 1043 aa27.79■■■□□ 2.04
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CTU2-210ENST00000567949 NLRP1Q9C000 1473 aa27.66■■■□□ 2.02
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CTU2-210ENST00000567949 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.64■■■□□ 2.02
CTU2-210ENST00000567949 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU2-210ENST00000567949 PRAM1Q96QH2 718 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU2-210ENST00000567949 DLC1Q96QB1 1528 aa27.62■■■□□ 2.01
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CTU2-210ENST00000567949 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
CTU2-210ENST00000567949 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-210ENST00000567949 POGKQ9P215 609 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-210ENST00000567949 PPP2R1AP30153 589 aa27.6■■■□□ 2.01
CTU2-210ENST00000567949 ABCC11Q96J66 1382 aa27.57■■■□□ 2
CTU2-210ENST00000567949 CABP2Q9NPB3 220 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-210ENST00000567949 INSRP06213 1382 aa27.55■■■□□ 2
CTU2-210ENST00000567949 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.55■■■□□ 2
CTU2-210ENST00000567949 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
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