RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 KIF1BO60333 1816 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 RGL3Q3MIN7 710 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 IQGAP1P46940 1657 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 BCANQ96GW7 911 aa26.14■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.14■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 PPLO60437 1756 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 TBX22Q9Y458 520 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 IFT172Q9UG01 1749 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 NEUROD1Q13562 356 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 DIP2AQ14689 1571 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 MYOM2P54296 1465 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 KCNA6P17658 529 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 PIK3C2GO75747 1445 aa25.95■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 METP08581 1390 aa25.95■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 CERKQ8TCT0 537 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 STAC3Q96MF2 364 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 PIK3R4Q99570 1358 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 ALKQ9UM73 1620 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 CPS1P31327 1500 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 PTPRUQ92729 1446 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 NWD1Q149M9 1564 aa25.89■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 TONSLQ96HA7 1378 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM94Q12767 1356 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 LAMC1P11047 1609 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 STK26Q9P289 416 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRB1O14514 1584 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC11Q96J66 1382 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 PTCH1Q13635 1447 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 TECPR2O15040 1411 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 C14orf37Q86TY3 774 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 FBXO41Q8TF61 875 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 SIRT1Q96EB6 747 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 MSH6P52701 1360 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 TOM1O60784 492 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 DLC1Q96QB1 1528 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 PRAM1Q96QH2 718 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 ATF3P18847 181 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 POGKQ9P215 609 aa25.56■■□□□ 1.68
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