RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562757.5

NAE1-208, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 2

Gene NAE1, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-208	ENST00000562757	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23
NAE1-208	ENST00000562757	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
NAE1-208	ENST00000562757	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.99	■■■□□ 2.23
NAE1-208	ENST00000562757	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.96	■■■□□ 2.23
NAE1-208	ENST00000562757	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
NAE1-208	ENST00000562757	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NAE1-208	ENST00000562757	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NAE1-208	ENST00000562757	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NAE1-208	ENST00000562757	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
NAE1-208	ENST00000562757	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		28.89	■■■□□ 2.22
NAE1-208	ENST00000562757	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NAE1-208	ENST00000562757	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
NAE1-208	ENST00000562757	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
NAE1-208	ENST00000562757	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
NAE1-208	ENST00000562757	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.82	■■■□□ 2.2
NAE1-208	ENST00000562757	PPL	O60437	1756 aa		28.8	■■■□□ 2.2
NAE1-208	ENST00000562757	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.79	■■■□□ 2.2
NAE1-208	ENST00000562757	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.78	■■■□□ 2.2
NAE1-208	ENST00000562757	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
NAE1-208	ENST00000562757	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.77	■■■□□ 2.2
NAE1-208	ENST00000562757	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.75	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.75	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.75	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.74	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.74	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.7	■■■□□ 2.19
NAE1-208	ENST00000562757	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.69	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	CPS1	P31327	1500 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	MYOM2	P54296	1465 aa		28.67	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	KCNA6	P17658	529 aa		28.67	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.65	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.65	■■■□□ 2.18
NAE1-208	ENST00000562757	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		28.64	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.63	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.63	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.59	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.59	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	MET	P08581	1390 aa		28.58	■■■□□ 2.17
NAE1-208	ENST00000562757	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.57	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.56	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.55	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.54	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.54	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.52	■■■□□ 2.16
NAE1-208	ENST00000562757	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
NAE1-208	ENST00000562757	LAMC1	P11047	1609 aa		28.5	■■■□□ 2.15
NAE1-208	ENST00000562757	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
NAE1-208	ENST00000562757	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		28.48	■■■□□ 2.15
NAE1-208	ENST00000562757	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.46	■■■□□ 2.15
NAE1-208	ENST00000562757	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.45	■■■□□ 2.15
NAE1-208	ENST00000562757	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.45	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.43	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		28.42	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.42	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	ABCC11	Q96J66	1382 aa		28.4	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.4	■■■□□ 2.14
NAE1-208	ENST00000562757	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		28.38	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	TECPR2	O15040	1411 aa		28.38	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.38	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.37	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	ADGRB1	O14514	1584 aa		28.37	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	SIRT1	Q96EB6	747 aa		28.36	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.35	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	STK26	Q9P289	416 aa		28.34	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.34	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	TOM1	O60784	492 aa		28.33	■■■□□ 2.13
NAE1-208	ENST00000562757	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.32	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	MSH6	P52701	1360 aa		28.32	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.31	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.29	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.29	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	DLC1	Q96QB1	1528 aa		28.28	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		28.27	■■■□□ 2.12
NAE1-208	ENST00000562757	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.26	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	DCC	P43146	1447 aa		28.25	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.25	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.25	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.24	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.23	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		28.23	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	ATF3	P18847	181 aa		28.21	■■■□□ 2.11
NAE1-208	ENST00000562757	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		28.2	■■■□□ 2.1
NAE1-208	ENST00000562757	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.2	■■■□□ 2.1
NAE1-208	ENST00000562757	PRAM1	Q96QH2	718 aa		28.19	■■■□□ 2.1

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