RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561277.5

TSPAN3-210, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-210ENST00000561277 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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TSPAN3-210ENST00000561277 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.29■■■□□ 2.28
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TSPAN3-210ENST00000561277 MST1RQ04912 1400 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPAN3-210ENST00000561277 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPAN3-210ENST00000561277 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
TSPAN3-210ENST00000561277 PRAM1Q96QH2 718 aa28.7■■■□□ 2.18
TSPAN3-210ENST00000561277 DLC1Q96QB1 1528 aa28.7■■■□□ 2.18
TSPAN3-210ENST00000561277 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.7■■■□□ 2.18
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