RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560650.1

CPEB1-AS1-201, CPEB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1-AS1, Length 2,138 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.83■■■□□ 2.21
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC24A1O60721 1099 aa28.64■■■□□ 2.18
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZFYVE9O95405 1425 aa28.53■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.53■■■□□ 2.16
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZMYM3Q14202 1370 aa28.4■■■□□ 2.14
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.35■■■□□ 2.13
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.34■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STK26Q9P289 416 aa28.3■■■□□ 2.12
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.24■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TNRQ92752 1358 aa28.23■■■□□ 2.11
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.22■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PTPRMP28827 1452 aa28.21■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.2■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 INSRP06213 1382 aa28.2■■■□□ 2.1
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CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PRAM1Q96QH2 718 aa28.19■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 POGKQ9P215 609 aa28.18■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BCANQ96GW7 911 aa28.18■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CABP2Q9NPB3 220 aa28.16■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.16■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NUDCQ9Y266 331 aa28.15■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
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