RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
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GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.8□□□□□ -0.68
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GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ABCC1P33527 1531 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZMYM3Q14202 1370 aa10.53□□□□□ -0.72
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GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OXER1Q8TDS5 423 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PREX2Q70Z35 1606 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CLIP1P30622 1438 aa10.52□□□□□ -0.73
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GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
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GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MROH2AA6NES4 1674 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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