RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 IFT172Q9UG01 1749 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 PPLO60437 1756 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 ZFYVE9O95405 1425 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 RGL3Q3MIN7 710 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 MYOM2P54296 1465 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 EID1Q9Y6B2 187 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 SLIT1O75093 1534 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 LAMC1P11047 1609 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-220ENST00000550700 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 PIK3C2GO75747 1445 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-220ENST00000550700 DIP2AQ14689 1571 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 MED14O60244 1454 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 SLC24A1O60721 1099 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 BCANQ96GW7 911 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 TBX22Q9Y458 520 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 ALKQ9UM73 1620 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 LTKP29376 864 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 PIK3R4Q99570 1358 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 IQGAP1P46940 1657 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-220ENST00000550700 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 ADGRB1O14514 1584 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 SIRT1Q96EB6 747 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 ABCC11Q96J66 1382 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 USP47Q96K76 1375 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 DLC1Q96QB1 1528 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 STRCQ7RTU9 1775 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-220ENST00000550700 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 TECPR2O15040 1411 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 HSPA2P54652 639 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 METP08581 1390 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 CPS1P31327 1500 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 KCNA6P17658 529 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 CDCA8Q53HL2 280 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 PTCH1Q13635 1447 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 POGKQ9P215 609 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 NWD1Q149M9 1564 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-220ENST00000550700 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-220ENST00000550700 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-220ENST00000550700 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
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