RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
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CS-215ENST00000549143 STK26Q9P289 416 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 PANK3Q9H999 370 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 ZMYM3Q14202 1370 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.53□□□□□ -0.56
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CS-215ENST00000549143 MADDQ8WXG6 1647 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 BCANQ96GW7 911 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 SYNMO15061 1565 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 ADGRB3O60242 1522 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 KIF1BO60333 1816 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 MROH2AA6NES4 1674 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 AGLP35573 1532 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 MYOM2P54296 1465 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 ERVK-7P63135 1459 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 CDCA8Q53HL2 280 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 TMC1Q8TDI8 760 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 PIK3C2GO75747 1445 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-215ENST00000549143 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 REREQ9P2R6 1566 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 POGKQ9P215 609 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 TNRQ92752 1358 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 PRAM1Q96QH2 718 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 PIK3C2BO00750 1634 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 RALBP1Q15311 655 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 CABP2Q9NPB3 220 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 LAMC1P11047 1609 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 SLC24A1O60721 1099 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
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CS-215ENST00000549143 PPLO60437 1756 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-215ENST00000549143 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 IQGAP1P46940 1657 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 ADGRB1O14514 1584 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 IFT172Q9UG01 1749 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 EVC2Q86UK5 1308 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 NLRP13Q86W25 1043 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 LTKP29376 864 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 ZFYVE9O95405 1425 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.36□□□□□ -0.59
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CS-215ENST00000549143 EID1Q9Y6B2 187 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 METP08581 1390 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 CDK19Q9BWU1 502 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-215ENST00000549143 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 NUTM2FA1L443 756 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 PPP2R1AP30153 589 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 ALKQ9UM73 1620 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 CABP1Q9NZU7 370 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 MORC1Q86VD1 984 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-215ENST00000549143 PTPRMP28827 1452 aa11.3□□□□□ -0.6
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