RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546930.5

CS-206, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-206ENST00000546930 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 NRXN1Q9ULB1 1477 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 MED14O60244 1454 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 MYOM2P54296 1465 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 LTKP29376 864 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 LAMC1P11047 1609 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 KNDC1Q76NI1 1749 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 ALKQ9UM73 1620 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 NWD1Q149M9 1564 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 PIK3C2GO75747 1445 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 DIP2AQ14689 1571 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 ADGRB1O14514 1584 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 PRAG1Q86YV5 1406 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 RGL3Q3MIN7 710 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 PTPRUQ92729 1446 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 NEUROD1Q13562 356 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-206ENST00000546930 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 CPS1P31327 1500 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 METP08581 1390 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-206ENST00000546930 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 TONSLQ96HA7 1378 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 TECPR2O15040 1411 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 CFAP70Q5T0N1 1121 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 EID1Q9Y6B2 187 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 DLC1Q96QB1 1528 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 ADGRB2O60241 1585 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 USP32Q8NFA0 1604 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 PTCH1Q13635 1447 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-206ENST00000546930 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 TBX22Q9Y458 520 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 PIK3R4Q99570 1358 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 TULP4Q9NRJ4 1543 aa12□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 KCNA6P17658 529 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 MYOM1P52179 1685 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 ABCC11Q96J66 1382 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-206ENST00000546930 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 TMEM94Q12767 1356 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 BCANQ96GW7 911 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 STAC3Q96MF2 364 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 STK26Q9P289 416 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 ITSN1Q15811 1721 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-206ENST00000546930 AKAP12Q02952 1782 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms