RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.2■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.16■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIP2AQ14689 1571 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NWD1Q149M9 1564 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPLO60437 1756 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFT172Q9UG01 1749 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HRCP23327 699 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FOXD1Q16676 465 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3R4Q99570 1358 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNA6P17658 529 aa23.98■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCANQ96GW7 911 aa23.98■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TBX22Q9Y458 520 aa23.98■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALKQ9UM73 1620 aa23.97■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.96■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.96■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.92■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOM1O60784 492 aa23.89■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM94Q12767 1356 aa23.88■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.87■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.86■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPRUQ92729 1446 aa23.85■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LAMC1P11047 1609 aa23.83■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYOM2P54296 1465 aa23.82■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.82■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 METP08581 1390 aa23.81■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3C2GO75747 1445 aa23.79■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.79■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.79■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MSH6P52701 1360 aa23.78■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGL3Q3MIN7 710 aa23.77■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.77■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTCH1Q13635 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.74■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIP4K2BP78356 416 aa23.74■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.74■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCCP43146 1447 aa23.73■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.73■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.7■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TECPR2O15040 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.67■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.66■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STAC3Q96MF2 364 aa23.65■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C14orf37Q86TY3 774 aa23.64■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSPA1LP34931 641 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PHLPP1O60346 1717 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLAIN2Q9P270 581 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRB1O14514 1584 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATF3P18847 181 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCC11Q96J66 1382 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MST1RQ04912 1400 aa23.58■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DLC1Q96QB1 1528 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIRT1Q96EB6 747 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRB2O60241 1585 aa23.48■■□□□ 1.35
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