RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.77■■■□□ 2.52
TSTA3-213ENST00000531006 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
TSTA3-213ENST00000531006 CPS1P31327 1500 aa30.77■■■□□ 2.52
TSTA3-213ENST00000531006 ZFYVE9O95405 1425 aa30.76■■■□□ 2.51
TSTA3-213ENST00000531006 FOXD1Q16676 465 aa30.75■■■□□ 2.51
TSTA3-213ENST00000531006 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
TSTA3-213ENST00000531006 CLTCL1P53675 1640 aa30.7■■■□□ 2.51
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
TSTA3-213ENST00000531006 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.69■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.68■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.67■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.66■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 TRPM2O94759 1503 aa30.66■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 KIF1BO60333 1816 aa30.64■■■□□ 2.5
TSTA3-213ENST00000531006 KCNA6P17658 529 aa30.63■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 PIP4K2BP78356 416 aa30.63■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.59■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 TOM1O60784 492 aa30.59■■■□□ 2.49
TSTA3-213ENST00000531006 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TSTA3-213ENST00000531006 TBX22Q9Y458 520 aa30.57■■■□□ 2.48
TSTA3-213ENST00000531006 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.55■■■□□ 2.48
TSTA3-213ENST00000531006 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM94Q12767 1356 aa30.51■■■□□ 2.47
TSTA3-213ENST00000531006 ALKQ9UM73 1620 aa30.51■■■□□ 2.47
TSTA3-213ENST00000531006 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.49■■■□□ 2.47
TSTA3-213ENST00000531006 RGL3Q3MIN7 710 aa30.47■■■□□ 2.47
TSTA3-213ENST00000531006 NWD1Q149M9 1564 aa30.46■■■□□ 2.47
TSTA3-213ENST00000531006 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.45■■■□□ 2.47
TSTA3-213ENST00000531006 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.44■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 DIP2AQ14689 1571 aa30.42■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 HSPA1LP34931 641 aa30.42■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.42■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 PTPRUQ92729 1446 aa30.41■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.4■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.39■■■□□ 2.46
TSTA3-213ENST00000531006 METP08581 1390 aa30.39■■■□□ 2.45
TSTA3-213ENST00000531006 PPLO60437 1756 aa30.38■■■□□ 2.45
TSTA3-213ENST00000531006 PIK3R4Q99570 1358 aa30.37■■■□□ 2.45
TSTA3-213ENST00000531006 C14orf37Q86TY3 774 aa30.34■■■□□ 2.45
TSTA3-213ENST00000531006 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.33■■■□□ 2.45
TSTA3-213ENST00000531006 HRCP23327 699 aa30.33■■■□□ 2.45
TSTA3-213ENST00000531006 MSH6P52701 1360 aa30.31■■■□□ 2.44
TSTA3-213ENST00000531006 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.31■■■□□ 2.44
TSTA3-213ENST00000531006 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.25■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 SLAIN2Q9P270 581 aa30.24■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 IFT172Q9UG01 1749 aa30.24■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.22■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.21■■■□□ 2.43
TSTA3-213ENST00000531006 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.19■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.19■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 ATF3P18847 181 aa30.18■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.17■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.15■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.14■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 STK26Q9P289 416 aa30.14■■■□□ 2.42
TSTA3-213ENST00000531006 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.12■■■□□ 2.41
TSTA3-213ENST00000531006 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.12■■■□□ 2.41
TSTA3-213ENST00000531006 PIK3C2GO75747 1445 aa30.08■■■□□ 2.41
TSTA3-213ENST00000531006 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.08■■■□□ 2.41
TSTA3-213ENST00000531006 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.07■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.06■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.04■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.04■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 PTCH1Q13635 1447 aa30.03■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.02■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 PHLPP1O60346 1717 aa30.02■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 MYOM2P54296 1465 aa30.01■■■□□ 2.4
TSTA3-213ENST00000531006 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 DCCP43146 1447 aa29.99■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 BRINP3Q76B58 766 aa29.99■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 MST1RQ04912 1400 aa29.98■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 ILDR2Q71H61 639 aa29.97■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC11Q96J66 1382 aa29.95■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.95■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
TSTA3-213ENST00000531006 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.95■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.91■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 TECPR2O15040 1411 aa29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 LAMC1P11047 1609 aa29.89■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 ORAI2Q96SN7 254 aa29.89■■■□□ 2.38
TSTA3-213ENST00000531006 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
TSTA3-213ENST00000531006 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.88■■■□□ 2.37
TSTA3-213ENST00000531006 NUTM2FA1L443 756 aa29.88■■■□□ 2.37
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