RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530346.5

GMDS-AS1-206, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 594 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.02■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.02■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BCANQ96GW7 911 aa27.02■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-206ENST00000530346 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.01■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.01■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TRPM2O94759 1503 aa27■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KCNA6P17658 529 aa26.99■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.98■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TBX22Q9Y458 520 aa26.97■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.96■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.96■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TOM1O60784 492 aa26.96■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.93■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CLTCL1P53675 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.89■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HRCP23327 699 aa26.89■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FOXD1Q16676 465 aa26.88■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.88■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PIK3R4Q99570 1358 aa26.87■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.87■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DIP2AQ14689 1571 aa26.84■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NWD1Q149M9 1564 aa26.84■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMEM94Q12767 1356 aa26.83■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.82■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KIF1BO60333 1816 aa26.81■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PIP4K2BP78356 416 aa26.8■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.79■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.75■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ALKQ9UM73 1620 aa26.75■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.74■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.73■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.72■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MSH6P52701 1360 aa26.7■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RGL3Q3MIN7 710 aa26.69■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PTPRUQ92729 1446 aa26.69■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 METP08581 1390 aa26.69■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HSPA1LP34931 641 aa26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.65■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.64■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C14orf37Q86TY3 774 aa26.62■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PPLO60437 1756 aa26.61■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.61■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.59■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SLAIN2Q9P270 581 aa26.59■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ATF3P18847 181 aa26.56■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DCCP43146 1447 aa26.52■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PTCH1Q13635 1447 aa26.52■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PIK3C2GO75747 1445 aa26.51■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IFT172Q9UG01 1749 aa26.51■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 STAC3Q96MF2 364 aa26.5■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MYOM2P54296 1465 aa26.49■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.48■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.47■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.47■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.46■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.45■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ABCC11Q96J66 1382 aa26.44■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TECPR2O15040 1411 aa26.41■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.41■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.4■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SIRT1Q96EB6 747 aa26.4■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.39■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 STK26Q9P289 416 aa26.39■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MST1RQ04912 1400 aa26.38■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BRINP3Q76B58 766 aa26.37■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.36■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.35■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LAMC1P11047 1609 aa26.34■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.32■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.32■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 JCADQ9P266 1359 aa26.29■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.28■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.28■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PHLPP1O60346 1717 aa26.27■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.25■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-206ENST00000530346 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms