RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529482.5

TSSC2-204, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSSC2, Length 2,337 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC2-204ENST00000529482 TMF1P82094 1093 aa20.59■□□□□ 0.89
TSSC2-204ENST00000529482 ZNF521Q96K83 1311 aa20.59■□□□□ 0.89
TSSC2-204ENST00000529482 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSSC2-204ENST00000529482 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.58■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.889e-6■■■□□ 15.6
TSSC2-204ENST00000529482 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.57■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 A2MP01023 1474 aa20.57■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 RGL3Q3MIN7 710 aa20.55■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.54■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 SLFN5Q08AF3 891 aa20.53■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 PPP2R1AP30153 589 aa20.53■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.52■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 USP19O94966 1318 aa20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 BECN1Q14457 450 aa20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 PLA2R1Q13018 1463 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.871e-8■■■□□ 18.9
TSSC2-204ENST00000529482 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 POGKQ9P215 609 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 UNC13BO14795 1591 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 PIK3C2GO75747 1445 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 DIP2BQ9P265 1576 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 IGHDP01880 384 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 PLCH2O75038 1416 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 CD109Q6YHK3 1445 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 SYNMO15061 1565 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 BCAR3O75815 825 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 E9PSI1 815 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 PDE3AQ14432 1141 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 PREX2Q70Z35 1606 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 NLRP1Q9C000 1473 aa20.39■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 SEC24BO95487 1268 aa20.39■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 GLI2P10070 1586 aa20.39■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 CDCA8Q53HL2 280 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ATP10AO60312 1499 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 IQGAP1P46940 1657 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 APAF1O14727 1248 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 NGEFQ8N5V2 710 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.36■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.36■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 PLXNC1O60486 1568 aa20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 FANCAO15360 1455 aa20.34■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ZMYM3Q14202 1370 aa20.34■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.32■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 TSPOAP1O95153 1857 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 MADDQ8WXG6 1647 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 MYOM1P52179 1685 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 AAMPQ13685 434 aa20.3■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.3■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 COG6Q9Y2V7 657 aa20.3■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.29■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 PANK1Q8TE04 598 aa20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 FSD2A1L4K1 749 aa20.27■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.26■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.25■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 ADGRL1O94910 1474 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 MCM4P33991 863 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 CLCN1P35523 988 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms