RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNARE1-208	ENST00000524325	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.64	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	LTK	P29376	864 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TSNARE1-208	ENST00000524325	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TSNARE1-208	ENST00000524325	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TSNARE1-208	ENST00000524325	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSNARE1-208	ENST00000524325	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	PPL	O60437	1756 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLIT1	O75093	1534 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	MYOM2	P54296	1465 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSNARE1-208	ENST00000524325	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSNARE1-208	ENST00000524325	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TSNARE1-208	ENST00000524325	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TSNARE1-208	ENST00000524325	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	MET	P08581	1390 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	STK26	Q9P289	416 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSNARE1-208	ENST00000524325	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	MED14	O60244	1454 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TSNARE1-208	ENST00000524325	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TSNARE1-208	ENST00000524325	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
TSNARE1-208	ENST00000524325	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TSNARE1-208	ENST00000524325	USP47	Q96K76	1375 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73	2e-6	■■■■■ 26.9
TSNARE1-208	ENST00000524325	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	LAMC1	P11047	1609 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.73
TSNARE1-208	ENST00000524325	KCNA6	P17658	529 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.01	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.01	■■■□□ 2.72
TSNARE1-208	ENST00000524325	POGK	Q9P215	609 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TSNARE1-208	ENST00000524325	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TSNARE1-208	ENST00000524325	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TSNARE1-208	ENST00000524325	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TSNARE1-208	ENST00000524325	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TSNARE1-208	ENST00000524325	TESK2	Q96S53	571 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TSNARE1-208	ENST00000524325	TECPR2	O15040	1411 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TSNARE1-208	ENST00000524325	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
TSNARE1-208	ENST00000524325	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	CPS1	P31327	1500 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
TSNARE1-208	ENST00000524325	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TSNARE1-208	ENST00000524325	NWD1	Q149M9	1564 aa		31.81	■■■□□ 2.68

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